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  1. MATLAB源码：图挖掘算法论文的解析

  2. 人类基因组计划的基本完成表明后基因组时代的到来。 人类积累的大量的生物信息数据为揭开生命奥秘提供了数据基础,生物学研究的热点由对细胞内个别基因或蛋白质功能的局部性研究,转移到以细胞内全部的基因、蛋白质及代谢产物为整体对象的系统研究。对基因调控网络、蛋白质相互作用网络、代谢路径网络等结构及功能模块的检测技术的研究,逐步把分子生物学推入系统生物学时代。 基因与蛋白质通过网状的相互作用产生更高一级的功能模块,所以,通过数学建模来设计有效的算法,在生物网络中进行功能模块的挖掘和分析,将有助于更好地研究

  3. 所属分类：专业指导

    • 发布日期：2012-11-22
    • 文件大小：725
    • 提供者：checkpaper

  1. ocean:R包用于代谢酶富集分析-源码

  2. 海洋 R包用于代谢酶富集分析 概述 代谢组学数据集所包含的功能洞察力目前尚未得到充分利用。这部分是由于代谢React网络的复杂性以及React通量和代谢物丰度之间的间接关系。然而，基于足迹的方法已经在数十种其他眼科数据集（如转录组和磷酸化蛋白质组学）的背景下可用。在这里，我们介绍ocEAn，该方法可从recon2React网络的简化精简版本中定义代谢酶的足迹，并以与激酶底物相同的方式，使用它们来探索代谢物丰度相对于代谢酶的相对位置的协调失调。和TF-targets富集分析。 教程 安装软件包（从

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-19
    • 文件大小：9437184
    • 提供者：weixin_42178688

  1. D-PPIN:动态蛋白质-蛋白质相互作用网络数据集-源码

  2. 密码 D-PPIN是一个动态网络数据集，由12个不同的酵母细胞动态蛋白质-蛋白质相互作用网络组成。 D-PPIN的统计 在D-PPIN的每个动态网络（例如Krogan_LCMS）中，节点表示编码蛋白质的基因，边缘表示在某个时间戳记下的蛋白质-蛋白质相互作用，并且每个边缘都带有时间戳记（例如node_u，node_v，时间戳记，权重）。 D-PPIN的产生 简而言之，构建动态蛋白质-蛋白质相互作用网络需要两个组件。 第一个是静态蛋白质-蛋白质相互作用网络，第二个是该静态网络中每种蛋白质的时间感知基

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-06
    • 文件大小：12582912
    • 提供者：weixin_42128270

  1. 代谢网络分析-源码

  2. 该存储库包含用于代谢网络分析和执行通量平衡分析（FBA）的MATLAB和Python脚本，以及示例性代谢模型和实验通量数据。 该存储库由BitBucket专用托管，并在GitHub上公开镜像。 文件和资源类型： .m文件： MATLAB脚本文件。 可以使用MATLAB或GNU Octave打开/执行。 .mat文件： MATLAB数据文件。 要在GNU Octave中打开.mat文件，请使用load命令：“ load” .py文件： Python脚本文件。 大多数/某些文件是为pytho

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-19
    • 文件大小：2097152
    • 提供者：weixin_42175035

  1. graphia：用于创建和分析图的可视化工具-源码

  2. Graphia是功能强大的开源视觉分析应用程序，旨在帮助解释大型和复杂的数据集。 产品特点 支持从原始CSV到GraphML的多种输入数据格式 使用诸如Pearson相关系数的算法创建相关图 可视化数百万个数据点和关系 交互式可视化和2D或3D布局 基于属性信息的灵活搜索功能 使用Louvain或MCL算法进行快速，可调整的网络群集 图形度量算法，包括PageRank，Beetess和偏心率 富集分析 根据基于数字或字符串的属性表达式过滤图形元素 可定制且易于使用的网络搜索 轻松导出和共享分析结

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-05
    • 文件大小：31457280
    • 提供者：weixin_42138525

  1. 酵母-GEM：酿酒酵母的共识GEM-源码

  2. 酵母-GEM：酿酒酵母的共有基因组规模的代谢模型 简要型号说明： 该库包含酿酒酵母的当前共有的基因组规模的代谢模型。 这是遗留项目的延续。 有关最新版本，请。 模型关键字： 创业板类别：种类； 用途：实验数据重建，多组学综合分析，计算机应变设计，模型模板； 领域：代谢网络重建； 模型类型：重建，策划； 模型源： YeastMetabolicNetwork； Omic来源：基因组学，代谢组学； 分类学：酿酒酵母; 代谢系统：一般代谢； 生物React器; 应变： S288C; 条件：有氧，

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-04
    • 文件大小：5242880
    • 提供者：weixin_42123191