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NTSYS-PC(分子生物学分析软件)
NTSYSPC是一个类聚类的分析软件,可用于很多的生物信息学分析,比如MLST,RFLPD等,也可以用于微生物群落多样性分析
所属分类:
其它
发布日期:2018-07-08
文件大小:1048576
提供者:
qq_38661320
FastMLST::high_voltage::dna:FastMLST-源码
快速MLST 多核多基因座序列分型工具,结合等位基因串联。 介绍 FastMLST是用Python3编写的高速独立脚本,它采用FASTA格式的程序集(也允许压缩),并根据定义的MLST方案确定其ST。 与其他ST确定程序相比,主要优点是FastMLST允许生成FASTA文件,该文件包含所有已分析的基因组的串联等位基因,这些基因组已准备好进行比对并用于系统发育推断。 您可以在我们的阅读有关MLST分析的完整指南。 安装 当前,安装此脚本的唯一方法是使用Conda。 conda config
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-07
文件大小:27648
提供者:
weixin_42157166
Frontiers_Micro_salmonella_infantis_newport_typhimurium_genomics:肠道沙门氏菌谱系I的三种血清型的人群基因组计划-源码
项目 肠道沙门氏菌谱系I-> Infantis,Newport和Typhimurium的三种血清型的种群基因组计划。 目标 对公开可用的基因组数据集进行启发式挖掘以实现以下目标: 使用基于层次的种群结构分析来映射全基因组以进行基因座发现和性状预测 在每个血清群中鉴定新的隐藏变体或潜在的生态型 方法 计算平台ProkEvo用于处理末端成对的Illumina原始序列,以产生以下输出:核心基因组比对,BAPS,MLST,SISTR,AMR定位,质粒鉴定和全基因组注释。 FasTree用于构建核
所属分类:
其它
发布日期:2021-04-01
文件大小:180224
提供者:
weixin_42160376