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资源分类
搜索资源列表
生物系统发育树的图形化显示软件
生物系统发育树的图形化显示软件 着重研究系统发育树(进化树)的描述方法、进化树表示的Newick格式(一种嵌套结构的文本)、运用栈的数据结构与算法于自动解析文本描述的进化树拓扑结构、以及进化树的图形编程实现技术等。
所属分类:
其它
发布日期:2010-03-16
文件大小:959488
提供者:
cnayr
生物信息学软件用于序列比对和系统发育树构建
生物信息学软件,MEGA,molecular evolution genetics analysis,分子生物进化遗传分析工具,用于生物信息学序列比对,和系统发育树构建
所属分类:
教育
发布日期:2011-05-20
文件大小:8388608
提供者:
yangxiao985
生物统计学软件用于构建系统发育树
生物信息学软件,用于构建系统发育树等信息.在生物信息学领域有重要应用和使用价值
所属分类:
教育
发布日期:2011-05-20
文件大小:959488
提供者:
yangxiao985
16SrDNA序列对细菌进行系统发育树
16S rDNA序列分析法制作系统发育树
所属分类:
其它
发布日期:2013-08-29
文件大小:88064
提供者:
u011877921
一株野生细菌的16SrDNA序列分析与系统法约束的构建
野生细菌利用16SrDNA法系统发育树构建
所属分类:
其它
发布日期:2013-08-29
文件大小:90112
提供者:
u011877921
系统发育树
系统发育树构建的i型昂昂。aln文件格式
所属分类:
其它
发布日期:2013-12-22
文件大小:169984
提供者:
u013244088
系统发育树构建方法
系统发育树构建方法,讲解请详细,可以帮助生物学人学习系统发育树的构建
所属分类:
专业指导
发布日期:2014-03-20
文件大小:1048576
提供者:
u014250677
MEGA软件 系统发育树构建方法(图文讲解)
此文件为MEGA软件的使用教程,简明、清晰、使用图文的方式讲解系统发育树构建方法,为生物学相关专业使用
所属分类:
讲义
发布日期:2014-08-07
文件大小:1048576
提供者:
sinat_19064035
使用PhyML构建系统发育树
使用PhyML构建系统发育树,将后缀名改成 trees 之后可以使用 treeview 等软件查看结果树
所属分类:
专业指导
发布日期:2015-03-05
文件大小:142336
提供者:
qq_26337005
Figtree v1.4.0
是一款系统发育树显示软件,方便简洁,可对系统发育树进行处理优化
所属分类:
教育
发布日期:2015-03-11
文件大小:7340032
提供者:
qq_26489085
mega画系统发育树
16S基因片段组装,在NCBI中进行Blast比对,利用下载的序列在mega绘制进化树,多组图片作为详解!
所属分类:
讲义
发布日期:2018-05-17
文件大小:15728640
提供者:
vivianzzc
系统发育分析
系统发育(Phylogeny),也叫系统发生,是指任何实体(基因、个体、种群、物种等)的起源和演化关系。 将进化论的原理拓展到DNA水平和蛋白质序列水平,通过多重序列比对,研究一组相关的基因或蛋白质,推断和评估不同基因间的进化关系,其中包括分子进化(基因树)和物种进化(物种树)。
所属分类:
讲义
发布日期:2018-08-06
文件大小:8388608
提供者:
qq_40619353
基于28S rDNA和COI基因的反颚茧蜂亚科9属系统发育关系研究(膜翅目:茧蜂科)
基于28S rDNA和COI基因的反颚茧蜂亚科9属系统发育关系研究(膜翅目:茧蜂科),黄珺,陈家骅,本文基于28S rDNA和COI基因序列,以最大似然法(ML)和最大简约法(MP)构建分子发育树,探讨反颚茧蜂亚科9属之间的系统发育关系。反�
所属分类:
其它
发布日期:2020-02-13
文件大小:395264
提供者:
weixin_38702110
浅谈系统发育分析及进化树制作.ppt
系统发育分析是研究物种进化和系统分类的一种方法,研究对象为携带遗传信息的生物大分子序列,采用特定的数理统计算法来计算生物间的生物系统发生的关系。并用系统进化树来概括生物间的这种亲缘关系。
所属分类:
讲义
发布日期:2020-02-03
文件大小:3145728
提供者:
qq_20389113
ncp-group1:用于储存病毒系统发育树相关的代码和数据-源码
ncp-group1 用于储存病毒系统发育树相关的代码和数据 一组:2019-nCoV系统发育分析与微进化研究 数据来源: 基因组序列数据库: (登录号NMDC10013002和基因组登录号NMDC60013002-01至NMDC60013002-10) (登录号CNA0007332–35) 软件工具: 序列比对 爆破 构建进化树 激光基因7.0 巨型6.0 菲利普 评估分子进化率 FUBAR:快速无约束贝叶斯近似 研究方案 1.基因组序列下载 姓名 来源 数据库(ID) 序列长度 下载
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-11
文件大小:8388608
提供者:
weixin_42162216
tree2graph:将系统发育树转换为图并将其合并为最终图-源码
tree2graph 将系统发育树转换为图并将其合并为最终图 用法: newickTree_2_CytoscapeLink.pl:转换树(newick格式)以链接信息; treeLinks_merge.pl:合并多棵树的链接信息; generate_nodeSize.pl:根据登录和共同祖先的出现次数生成不同大小的节点; 使用Cytoscape可视化图形。
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-10
文件大小:129024
提供者:
weixin_42116672
基于H曲线距离的DNA序列的系统发育树。
本文提出了用H曲线来表示线粒体DNA序列,通过H曲线压缩定义距离,H曲线均值定义距离和H曲线点差定义距离等方法计算DNA序列间距离相似矩阵,发生树。
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-09
文件大小:125952
提供者:
weixin_38502183
ab12phylo:AB12PHYLO:易于使用的集成应用程序,用于ML系统发育树推断-源码
AB12PHYLO 是一个集成的,易于使用的管道,用于根据ABI测序数据推断最大似然(ML)系统树。 AB12PHYLO的核心是运行并行实例(Kozlov等,2019),并在参考数据库中进行BLAST搜索。 它基于系统发生的位置和序列相似性,实现直观,轻松的样品识别,并借助Tajima D等指标对种群子集进行选择,以评估正在进行的进化。 开发AB12PHYLO来鉴定植物病原体种群,可能是通过与茄属的平衡选择,尤其是在链格孢菌(Alternaria)中。 尽管全基因组测序的兴起,尽管多基因系统
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-15
文件大小:10485760
提供者:
weixin_42143092
ggtree:系统发育树的可视化和注释-源码
ggtree:系统发育树的可视化和注释
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-05
文件大小:365568
提供者:
weixin_42131414
波罗的海:波罗的海-适应性强的轻型树导入代码,用于分子系统发育操纵,分析和可视化。 该派生叉将不再接收更新,因此对波罗的海的任何进一步开发都将在https:github.comevogytisbaltic上进行-源码
波罗的海:以反义词命名的自适应轻量级树导入代码 最初开发波罗的海以自定义方式从衍生的分子系统发育中提取各种统计数据。 我的使用波罗的海代码的早期版本来研究根据基因组背景如何构建人类乙型流感病毒片段多样性。 从那以后,我将代码的各个部分分为三部分: 波罗的海 是树解析器本身。 它使用三个主要类-节点,叶和树来导入,操纵和绘制具有多种注释的BEAST树。 节点和叶类引用了系统发育中常见的参数集-指定分支的字符串索引(树中的唯一标识符),长度,高度,时间位置(absoluteTime),X和Y坐标,对
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-04
文件大小:5242880
提供者:
weixin_42126865
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