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搜索资源列表

  1. 输入DNA序列输出氨基酸序列 c语言源码

  2. 输入一条字符串（由A、T、G、C构成）表式DNA的一条链，输出 1.DNA中与之对应的另外一条链 2.对应mRNA的结构(字符串表示) 3.由mRNA控制合成的蛋白质的氨基酸序列 的c语言源码

  3. 所属分类：C/C++

    • 发布日期：2011-08-15
    • 文件大小：3072
    • 提供者：gnemoug

  1. Data-Analysis:该存储库包含gen_analysis软件包，该软件包用于基本统计信息和生物数据处理-源码

  2. 数据分析 该存储库包含用于基本统计信息的程序包和用于生物数据的处理工具。 此外，不久将添加更多的蛋白质组和转录组分析功能。 这些将包括通过外源条形码对单细胞数据进行双重鉴定，通过变异系数和均值表达进行差分单细胞分析等。 要安装软件包，请转到gen_analysis文件夹，然后pip install -e . 。 依存关系 numpy的= = 1.19.0 熊猫== 1.0.1 matplotlib == 3.1.3 海上== 0.10.0 upsetplot == 0.4.0 more

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-26
    • 文件大小：1048576
    • 提供者：weixin_42119358

  1. 2021_Bottino_Biserial:2020年Bottino和Martínez的数据和范例-源码

  2. 2020_Bottino_Biserial_scr ipts 这些是脚本和示例数据文件，以及G. Bottino和L.Martínez撰写的文章《针对蛋白质建模中的约束选择的结构判别分析（XXX）》一文。 配置 为了遵循本教程，您将需要设置一些软件： 如果只想使用分析和选择脚本... M3G的最新版本的Lovoalign和G-Score软件。 您将需要一个FORTRAN编译器来构建那些程序。 我们建议Linux用户使用gfortran 。 如果您emply一个基于Ubuntu的发行，你可以

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-26
    • 文件大小：22020096
    • 提供者：weixin_42103587

  1. EpitopeFinder_package:蛋白质疏水性预测因子和表位作图者-源码

  2. EpitopeFinder_package 蛋白质疏水性预测因子和表位作图者

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-26
    • 文件大小：6144
    • 提供者：weixin_42131414

  1. EP-GBDT:EP-GBDT是仅通过使用序列信息来预测必需蛋白质的一种计算方法-源码

  2. 乙交酯 EP-GBDT是仅通过使用序列信息进行必需蛋白质预测的一种计算方法。 要求 numpy == 1.18.1 scikit学习== 0.23.1 imblearn == 0.7.0 用法 在这个GitHub项目中，我们提供了一个演示以演示EP-GBDT的工作方式。 在Raw data文件夹中，我们提供了原始蛋白质序列及其标签。 您可以将它们用于其他基于序列的必需蛋白质预测。 在“加工的特征”文件夹中，我们提供了通过伪氨基酸组成（PseAAC）工具获得的加工的蛋白质序列特征。 在通过8

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-25
    • 文件大小：18874368
    • 提供者：weixin_42134769

  1. iiitd-training-work-源码

  2. iiitd培训工作 了解从Firehose浏览器获得的TCGA数据集。 我们从firehoseftb存储库获取了21-03-2021的最新处理数据： ://gdac.broadinstitute.org/runs/stddata__2016_01_28/data/ 下载的TCGA RNASeq包含 行代表基因IDS 列代表样品名称。 对于每个样本，都有三列：raw_count，scaled_estimate和transcr ipt_id。 起始种质是假设的蛋白质基因，因此它们以?开头?

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-22
    • 文件大小：1024
    • 提供者：weixin_42140846

  1. Physalia_ML-源码

  2. Physalia_ML 生物学家的机器学习，动手入门 授课教师： Pietro Franceschi，Filippo Biscarini 提要使用现代定量技术表征复杂现象是几乎每个研究领域的标准方法。 生物学也不例外，并且在生命科学的方方面面都广泛使用多组学技术（代谢组学，转录组学，基因组学和蛋白质组学）。 最终的多元数据集非常复杂，需要应用高级数据分析方法来优化检索到的信息。 对于相对大规模的研究，机器学习是补充经典多元统计方法的有效工具。 本课程的目的是突出这些数据分析方法在生物学研究中

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-22
    • 文件大小：1048576
    • 提供者：weixin_42101384

  1. webmol:基于Java的蛋白质查看器和分析程序-源码

  2. WebMol 基于Java的蛋白质查看器和分析程序 启动WebMol（Windows：双击jar文件，Linux：java -jar webmol.jar）以PDB文件格式加载结构，方法是调用“打开”，或者在Linux下，将其作为参数：java -jar webmol.jar ：java -jar webmol.jar 有关帮助/说明，请参见“帮助” 参考：WebMol-基于Java的PDB查看器。 D Walther，生化科学趋势22（7），274-275 可根据要求提供源代码。 Web

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-22
    • 文件大小：1001472
    • 提供者：weixin_42133415

  1. AVA_hpa:hpa数据集中AVA的mindspore实现-源码

  2. AVA-hpa 内容 AVA-hpa是一个分为两个阶段的模型，包含自我监督的预训练阶段和监督的学习阶段。 AVA-hpa的目的是提高免疫荧光显微图像中蛋白质亚细胞定位识别的性能。 原始文件显示了AVA-hpa的整体网络架构。 原始数据集来自人类蛋白质图谱（ ）。 经过后期处理后，我们获得了一个包含4个部分（ ， ， ， ）的自定义数据集，大约为6.5GB。 数据集大小：173,594幅彩色图像（512 $ \ times $ 512），13,261袋，27个班级 数据格式：RGB图像

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-22
    • 文件大小：38912
    • 提供者：weixin_42140710

  1. sgas:SGAS-源码

  2. SGAS：顺序贪婪架构搜索 在搜索阶段具有较高验证准确性的体系结构在评估中可能会表现较差。为了缓解这一常见问题，我们引入了顺序贪婪体系结构搜索（SGAS），这是一种有效的神经体系结构搜索方法。通过将搜索过程划分为子问题，SGAS以贪婪的方式选择并修剪候选操作。我们将SGAS应用于卷积神经网络（CNN）和图卷积网络（GCN）的搜索体系结构。 概述 大量的实验表明， SGAS能够以最小的计算成本为蛋白质-蛋白质相互作用图中的图像分类，点云分类和节点分类等任务找到最先进的体系结构。 要求 （仅GC

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-22
    • 文件大小：1048576
    • 提供者：weixin_42127835

  1. Longevity-源码

  2. 项目概况 关于人类寿命GWAS的两个样本孟德尔随机分析，研究了与长寿结果相关的新的和已知的暴露关系。 测试添加到rsID映射分支 A.接触 可从以下目录从mrbase.org网站获得曝光 NHGRI-EBI GWAS目录 MR BASE GWAS目录 基因表达QTL 蛋白质水平QTL 代谢物水平OTL 甲基化水平QTL B.结果 从CPMC获得的成果数据已被Deelen等人（2019（ ））和UK Biobank使用。 英国生物库研究 皮林等。 PMID：29227965。人类寿命：在38

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-22
    • 文件大小：4194304
    • 提供者：weixin_42104366

  1. Protein-integration-源码

  2. 蛋白质整合

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-21
    • 文件大小：2048
    • 提供者：weixin_42113380

  1. motif-mark-oop:卡带外显子图案可视化，面向对象-源码

  2. 图案标记oop motif_mark_oop.py脚本可将来自fasta文件的基因片段上的基序可视化。包含Fasta标头，外显子，基序和一般基因组的类。 概括 在被翻译成蛋白质之前，mRNA经历了剪接过程，以去除内含子并将外显子粘贴在一起。通常，mRNA可以被剪接，产生可能对某种细胞类型或功能具有特异性的同工型。选择性剪接可通过某些基序或短序列的存在来介导，其中调节剪接的蛋白结合或定位。该脚本的目的是快速可视化基因片段和基序的位置。 输入 包含内含子为小写而外显子为大写的基因的fasta文件

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-21
    • 文件大小：20480
    • 提供者：weixin_42131013

  1. APQ：具有数据独立采集功能的无标签绝对蛋白质定量-源码

  2. 无标记的绝对蛋白质定量，独立于数据的采集 这是一个R软件包，可使用数据独立采集（DIA）进行无标签的绝对蛋白质定量（APQ）。 该程序包是基于TPA方法和一种将MS信号从共享肽重新分布到单个蛋白质或同工型的算法开发的。 如果有任何问题或错误，请给我发送电子邮件： 引文 何兵，石健，王新文，江辉，朱浩杰。“无标签的绝对蛋白质定量和数据独立采集。” 蛋白质组学。 2019五月30; 200：51-59。 doi： 。 在R上安装“ APQ”软件包： 如果未安装软件包“ devtools”，请运

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-02
    • 文件大小：12288
    • 提供者：weixin_42137028

  1. 密码子优化：使用机器学习来设计密码子优化的DNA序列，以提高蛋白质表达-源码

  2. 密码子优化 使用机器学习设计密码子优化的DNA序列，以增加CHO细胞中的蛋白质表达。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-28
    • 文件大小：37748736
    • 提供者：weixin_42100032

  1. 蛋白质数据提取：使用熊猫从UniProt中提取蛋白质数据-源码

  2. 蛋白质数据拉 使用熊猫从UniProt中提取蛋白质数据

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-15
    • 文件大小：13312
    • 提供者：weixin_42099755

  1. 蛋白质2-源码

  2. 投资组合游戏图像 投资组合游戏图像

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-14
    • 文件大小：659456
    • 提供者：weixin_42134051

  1. ProteinTracker：一个iOS应用程序，可帮助人们在健美运动中简单有效地跟踪蛋白质摄入量-源码

  2. ProteinTracker：一个iOS应用程序，可帮助人们在健美运动中简单有效地跟踪蛋白质摄入量

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-14
    • 文件大小：375808
    • 提供者：weixin_42097914

  1. 蛋白质问题-源码

  2. 蛋白质问题 迪尔蒂奥·达·Kong普塔科的信条，迷你主义的皮埃尔教授·埃尔维拉·帕多瓦·洛瓦特。 合作： 安德烈·路易斯·皮奥纳·德·阿劳霍 布鲁诺·坎波斯 吉尔赫姆·阿尔马达（Guilherme Almada） 吉列尔梅·马丁斯（Guilherme Martins） 希格·韦伯 乔尼斯·威廉姆斯 马塞洛·安托利尼（Marcelo Antolini） 马塞洛·奥尔蒂斯（Marcelo Ortiz） 马科斯·鲁伊·泽维尔 马科斯·奥利维拉（Marcos Oliveira） 马修斯·古

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-13
    • 文件大小：24576
    • 提供者：weixin_42133861

  1. GNNs用于蛋白质-蛋白质相互作用-源码

  2. 探索图注意力网络架构和图卷积架构以对蛋白质-蛋白质相互作用数据集中的节点进行分类。 在pytorch中实现。 如何运行： 安装requirements.txt中所述的requirements.txt 要运行火车脚本，请使用以下命令： python train.py --model_type= --input_dir= --output_dir=<dir to save the model, e.g.

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-09
    • 文件大小：8388608
    • 提供者：weixin_42159267
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