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内容 概述 Discount是一个基于Spark的工具，用于k-mer计数和最小化器顺序分析。 它能够分析大型宏基因组规模的数据集，而占用的内存却很小。 该软件包括UF Petrillo等[1]的 。 我们还包括了由 [2]生成的紧凑型通用击中集。 有关详细的背景和说明，请参阅[3]的论文。 基本 是可选的。 如果您不想自己编译Discount，则可以从“页面下载预构建的版本。 跑步折扣 Spark应用程序（例如Discount）可以在笔记本电脑，群集或云中本地运行。 在Google Clo

项目模块/硕士论文 对不同的分类工具进行基准测试，以确保其在宏基因组长读中的可用性。 工具 分类工具 工具 版本 类型 方法 参考 开重 1.7.4 蛋白质 FM索引，对齐 KrakenD2 2.0.7-测试版 脱氧核糖核酸 聚体 离心机 1.0.4 脱氧核糖核酸 FM索引 taxMaps 0.2 脱氧核糖核酸 FM索引 深微生物 git rev。 43b654b 脱氧核糖核酸 机器学习，k-mer MetaOthello git rev。 15ded5e 脱氧核糖核酸