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搜索资源 - 集合体:基于CWL的PacBio和Illumina数据自动生物信息学工作流程-源码
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集合体:基于CWL的PacBio和Illumina数据自动生物信息学工作流程-源码
基于CWL的工作流来组装非模型生物的单倍体/二倍体真核生物基因组 该工作流程旨在使用PacBio的长读和Illumina的短读。 该工作流程首先提取,校正,修剪和净化长阅读。 然后将去污的修剪后的读数用于组装基因组,并使用原始读数来对其进行修饰。 接下来,将Illumina的读数清洗并用于进一步抛光所得组件。 最后,使用推断的重复序列对抛光的组件进行遮罩,并消除单倍型。 该工作流程使用BioConda和DockerHub安装所需的软件,因此是完全自动化的。 除最终装配外,工作流程还会在抛光步骤之
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-15
文件大小:393216
提供者:
weixin_42168745