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CAMPHOR:SV来电者,可长时间阅读-源码
樟 SV来电者,可长时间阅读 概述 提取的读物表明来自bam文件的SV的存在 确定SV候选人 使用重复信息和支持读取次数过滤SV候选对象 要求 python3 python的pysam模块 numpy模块 Perl samtools(0.1.18版或更高版本) 输入文件 两个bam文件(一个bam按读取名称排序,另一个bam按基因组坐标排序) 按基因组坐标排序的bam文件的索引文件(.bai) 序列数据的Fastq文件 如果环境中未安装samtools,则可以在配置文件(pram.conf
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-08
文件大小:8388608
提供者:
weixin_42107491