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  1. freesurfer重编环境

  2. 2. Open Source Distribution see ReadOnlyCVS 3. Configuring It is necessary to run a pre-configure scr ipt, to create the platform specific tools required by configure (execute in the dev/ directory created by cvs checkout): ./setup_configure This sc

  3. 所属分类：C

    • 发布日期：2011-09-01
    • 文件大小：111616
    • 提供者：cfy346884150

  1. 使用freesurfer来划分脑区

  2. 有关脑区划分的文章，使用该文章可以为我们提供很好的思路

  3. 所属分类：医疗

  1. FreeSurfer图像分析软件在视觉功能磁共振研究中的运用

  2. FreeSurfer在核磁图像的运用的一篇论文

  3. 所属分类：医疗

    • 发布日期：2014-11-19
    • 文件大小：103424
    • 提供者：caoyuan1983

  1. Freesurfer在弱视患者视区脑皮质厚度的技术应用_齐顺 (1).caj

  2. Freesurfer在弱视患者视区脑皮质厚度的技术应用_齐顺 (1).cajFreesurfer在弱视患者视区脑皮质厚度的技术应用_齐顺 (1).cajFreesurfer在弱视患者视区脑皮质厚度的技术应用_齐顺 (1).caj

  3. 所属分类：医疗

    • 发布日期：2018-03-25
    • 文件大小：238592
    • 提供者：qz1992

  1. FreeSurfer的安装教程

  2. FreeSurfer的安装教程，如果有问题，欢迎留言，一定全力解决

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2018-10-17
    • 文件大小：13312
    • 提供者：u013132035

  1. ubuntu12.04下安装freesurfer文件 libXss.so.1.0.0；libjpeg.so.8.0.2

  2. ubuntu12.04下安装freesurfer必备来两个安装文件 ##**这里必须要说明一点，linux下的权限控制是非常严格的，基本上你放进usr/local 里的软件你没有权利在里边进行任何写的操作，所以建议把usr/local下边的freesurfer文件夹拷贝到home目录下面，这个目录下可以各种操作，其实freesurfer官方是建议安装到usr/local下的，但是我吃亏了。。。所以建议非linux大神，还是省事一些，放在home下边，跟desktop并列的目录下。然后你需要将

  3. 所属分类：医疗

    • 发布日期：2019-03-07
    • 文件大小：106496
    • 提供者：huiyuanliyan

  1. surface-based group analysis in Freesurfer.pptx

  2. surface-based group analysis in freesurfer，downloaded from the freesurfer wiki

  3. 所属分类：讲义

    • 发布日期：2020-01-30
    • 文件大小：5242880
    • 提供者：weixin_45109848

  1. t1_t2_ratio_pipeline-源码

  2. t1_t2_ratio_pipeline 利用标准化的图像，按比例生产的产品以及贴花的FreeSurfer。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-17
    • 文件大小：10240
    • 提供者：weixin_42172204

  1. extract-rsfc-pipeline:基于表面的rs-fMRI预处理脚本，用于从原始粗体时间序列和T1w图像中提取静止状态功能连接（RSFC）矩阵-源码

  2. 提取rsfc管道 基于表面的rs-fMRI预处理脚本，用于从原始粗体时间序列和T1w图像中提取静止状态功能连接（RSFC）矩阵。 要求 FreeSurfer Connectome工作台 空军情报局 具有MSM（多峰表面匹配）的FSL 筛选 在具有多个库的python 3环境中 将通过脚本自动安装几个软件包 pip install ciftify 提供的文件 run_proc.sh 主要预处理脚本 ext_rsfc.py 从dtseries.nii提取RSFC矩阵的代码 Gordon_352

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-12
    • 文件大小：229376
    • 提供者：weixin_42113754

  1. cmtklib-data-源码

  2. CMTK数据 概述 Datalad数据集，用于存储Connectome Mapper 3（ ）的cmtklib模块的所有数据资源。 colortable_and_gcs存储洛桑2008 colortable_and_gcs所有数据资源（gcs地图集文件和色表） diffusion存储CMP2使用的梯度表和ODF方向文件 parcellation包含所有GRAPHML和Freesurfer颜色LUT为本地Freesurfer，2008年洛桑和洛桑2018 parcellations，与另外A

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-09
    • 文件大小：275456
    • 提供者：weixin_42166261

  1. mpr_analysis-源码

  2. 关于 珍娜·杨（jmschabdach） 获取FreeSurfer输出并将其转换为可以在Python / R分析中更轻松地使用的格式。 要求 在Python中 sqlite3 pandas

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-06
    • 文件大小：558080
    • 提供者：weixin_42179184

  1. zeffiro_interface：在电磁脑成像中使用有限元的接口-源码

  2. Zeffiro接口（ZI），:copyright:2018- Sampsa Pursiainen＆ZI开发团队，是一个开放源代码包，构成基于EEG / MEG的正向和反向模拟的有限元（FE）的可访问工具，也可以用于其他生物电磁成像中针对大脑的应用程序。 使用ZI，如果可以使用三角ASCII曲面网格（DAT或ASC文件格式），则可以分割实际的多层几何体并生成多隔室的FE网格。 例如，可以使用FreeSurfer软件套件（版权:copyright:FreeSurfer，2013）产生合适的表面分割。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-25
    • 文件大小：91226112
    • 提供者：weixin_42134168

  1. CogRehab_MRI_server-源码

  2. CogRehab_MRI_server 皇家渥太华精神健康中心的BIC服务器上用于MRI分析的Shell和R脚本。 科格设置FreeSurfer的环境（设置FREESURFER_HOME，FSFAST_HOME和SUBJECTS_DIR）并导航到CogRehab研究的scr ipts文件夹 这需要对〜/ .bashrc文件进行一些修改。 首先需要在〜/ .bashrc中添加以下内容：alias COGREH ='export SUBJECTS_DIR = / group / guimond_

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-16
    • 文件大小：9216
    • 提供者：weixin_42170790

  1. freesurferformats-源码

  2. freesurferformats GNU R软件包用于读取和写入（不仅是）FreeSurfer神经影像文件格式。 带有对许多标准网格文件格式的支持。 | | | | | 最终用户注意事项 此低级软件包为神经影像数据提供了经过良好测试的文件格式读取器和写入器。 通常，在进行神经成像研究时，您不仅要访问单个文件，还要访问存储在recon-all（您的$ SUBJECTS_DIR）的标准化输出结构中的主题的数据集。 在这种情况下，我建议使用的高级功能，而不要重新发明轮子。 fsbrain软件包建

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-12
    • 文件大小：3145728
    • 提供者：weixin_42136826

  1. app-multiAtlasTT：maTT的brainlife.io版本-源码

  2. app-multiAtlasTT 多图集传输工具（maTT）的版本。 该应用程序接收一个完整的recon-all FreeSurfer目录，并在个人的T1w空间中输出体积分割。 这些工具使用FreeSurfer提供的变形信息将小片段变形到主题空间。 这是maTT2的实现，它使用在数据上训练的gcs文件。 如果本地不存在，则会自动从提取GCS文件。 查看以获取更多信息和最新版本的maTT。 s 贡献者 资金确认 brainlife.io由公共资助，并且对于项目的可持续发展，有助于确认平台的

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-11
    • 文件大小：14336
    • 提供者：weixin_42109125

  1. BrodmannArea1_FunctionalFingertipAtlas：这些是使用FreeSurfer 6生成的标签文件，指示拇指（D1）和小指（D5）在对侧半球上的位置。 这些区域是根据左手和右手指尖的指尖刺激任务的皮质功能磁共振成

  2. -BrodmannArea1_FunctionalFingertipAtlas- 这些是用FreeSurfer 6生成的标签文件，指示拇指（D1）和小指（D5）在对侧半球上的位置。 这些区域是根据左手和右手指尖的指尖刺激任务的皮质功能磁共振成像图确定的。 样本量约为20名参与者。 更多详细信息即将发布。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-10
    • 文件大小：13312
    • 提供者：weixin_42109639

  1. tbi-pvs-pipe:用于不同队列的重复数据预处理程序的管道-源码

  2. tbi-pvs-pipe 用于不同队列的重复数据预处理程序的管道 概括 内容包括如何预处理来自压缩dicom扫描和csv摘要的数据。 它是一个共享的脚本目录，将不包含任何尚未公开发布的PVS算法或原始数据集。 我还将上载.pipe文件（这是LONI Pipeline用户的自动化图形版本），以预处理他们的数据 安装要求 具有科学环境的Python（需要熊猫和pytorch） 蚂蚁（请访问 ） FreeSurfer v5.3.0（请访问 ） FSL v5.0.11（请访问 ） QIT（请访

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-04-01
    • 文件大小：9216
    • 提供者：weixin_42099987

  1. freesurferformats-源码

  2. freesurferformats GNU R软件包用于读取和写入（不仅限于）FreeSurfer神经影像文件格式。 带有对许多标准网格文件格式的支持。 | | | | | 最终用户注意事项 此低级软件包为神经影像数据提供了经过良好测试的文件格式读取器和写入器。 通常，在进行神经成像研究时，您不仅要访问单个文件，而且要访问存储在recon-all（您的$ SUBJECTS_DIR）的标准化输出结构中的主题的数据集。 在这种情况下，我建议使用的高级功能，而不要重新发明轮子。 fsbrain软件

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-04-01
    • 文件大小：3145728
    • 提供者：weixin_42175035

  1. nipype:神经影像软件包的工作流程和接口-源码

  2. NIPYPE：Python中的神经成像：管道和接口 当前的神经影像软件为用户提供了使用多种不同算法分析数据的难得的机会。 但是，这导致了专用应用程序的异构集合，而没有透明的互操作性或统一的操作界面。 Nipype是NiPy旗下由社区开发的开放源代码计划，它是一个Python项目，可为现有的神经成像软件提供统一的界面，并促进单个工作流程中这些软件包之间的交互。 Nipype提供的环境鼓励交互式探索来自不同软件包（例如SPM，FSL，FreeSurfer，AFNI，Slicer，ANTS）的算法

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-31
    • 文件大小：3145728
    • 提供者：weixin_42105169

  1. antspriors-源码

  2. 蚂蚁 该图像接收来自fMRIPrep的解剖流的输出和ANTsSST的输出，以使用所提供的单个主题模板以及组织类先验来创建组模板，并使用各个会话的Freesurfer分段平均值（例如sub-SUBLABEL_ses）进行创建。 -SESLABEL_desc-aseg_dseg.nii.gz）。 它还执行联合标签融合，以将在OASIS大脑上定义的DKT标签放入组模板空间。 截至2021年3月25日，仅使用fMRIPrep v 20.0.5和ANTsSST v 0.0.7的输出对ANTsPriors

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-30
    • 文件大小：28311552
    • 提供者：weixin_42131861