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  1. ID16S:该管道从16S序列的multifasta文件中重建细菌物种的组成-源码

  2. 目录 介绍 ID16S流水线从16S扩增子序列的multifasta文件中重建细菌物种的组成。 推论来自针对NCBI 16S微生物数据库的同源性搜索。 该管道在使用16S Barcoding Kit(SQK-RAB204)获得的Nanopore 1D读数上进行了测试。 鉴定准确度与Nanopore测序读数的准确性相当。 该管道应适用于所有16S数据集,但较长的序列读取是可取的。 请注意,对于大型数据集,即使使用megablast算法,BLAST同源性搜索也需要一段时间才能完成。 对更快的工具感
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2021-03-11
    • 文件大小:2097152
    • 提供者:weixin_42099302