Snakemake中基于像素分类的异质多路复用组织图像柔性图像分割管线 该管道基于用于分割的CellProfiler （ ）和用于像素分类的Ilastik （ ）。 通过使用专门开发的imctools python软件包（ ）软件包以及自定义CellProfiler模块（ ）可以简化此过程。 该管道是在苏黎世大学的Bodenmiller实验室（ ）中开发的，用于分割高度多路复用的图像质谱分析（IMC）图像的杂音。 但是，它也已经成功地应用于其他多路复用成像方式。 找到的PDF描述