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搜索资源 - KMeansClusteringDNA:识别HepC爆发来源的K手段-源码
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KMeansClusteringDNA:识别HepC爆发来源的K手段-源码
这是“ K均值”聚类用于识别肝炎C暴发源的示例。 该项目的K Means部分完全从头开始编码,没有使用任何K Means库。 首先从处理.fas文件中的数据到我拥有一个数组(每个索引包含一个基因组)的地方开始。 然后,它计算每个基因组之间的汉明距离。 然后,我通过“多维缩放”来运行它,以获取数据的散点图以及该数据的数据帧。 我使用散点图来确定数据中有8个簇。 有了这些知识,我便可以通过我的K Means方法运行数据框。 K Means方法遵循以下过程: 指定要分配的集群数 随机初始化K重心
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-15
文件大小:35840
提供者:
weixin_42160398