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birm:贝叶斯项目响应模型-源码
birm:贝叶斯项目响应模型 该软件包旨在用作贝叶斯项目响应建模的“即插即用”工具。 当前,已实现特定的一维IRM,但将来的版本将旨在为中级和高级用户增加更多的灵活性。 birm依赖于LaplacesDemon,这是一个开源统计软件包,旨在为贝叶斯推理提供完整的环境。 该软件包应视为实验性的。 实现了以下模型: Rasch模型( rasch功能) 部分和广义部分信用模型( pcm函数) 评级和广义评级量表模型( rsm函数) 1、2、3、4和5参数Logistic模型( plm函数)
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-26
文件大小:439296
提供者:
weixin_42127783
amsi:基于任意边际仿真的推理-源码
基于任意边际模拟的推理 参考 article { hermans2019likelihood , title = { Likelihood-free MCMC with Amortized Approximate Ratio Estimators } , author = { Hermans, Joeri and Begy, Volodimir and Louppe, Gilles } , journal = { arXiv preprint arXiv:1903.04057 } ,
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-25
文件大小:20480
提供者:
weixin_42115074
pharmsignal:药理数据中的信号检测(药物警戒性)-源码
pharmsignal 药理数据中的安全信号检测(药物警戒)。 报告奇数比(ROR),比例报告比(PRR),贝叶斯置信度传播神经网络信息组件(BCPNN IC,MCMC和正态近似)的实现以及序列对称性分析(SSA)的实现。 背景 药品不良事件的信号检测通常需要分析下表中列出的计数数据。 Event(s) X Event(s) Y Drug(s) A 一种 b Drug(s) B C d 该软件包具有计算以下信号检测方法的功能: ror_signal() : ror_sign
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-22
文件大小:36864
提供者:
weixin_42117267
parser:使用生成语法模型的语义解析器归纳-源码
待办事项:记录此代码。该存储库位于 。 该代码实现了所述的实验。它使用语义语法的生成模型,该模型被实现为单独的模块化存储库(在那里实现了解析和MCMC采样算法)。 如果您在研究中使用此代码,请引用: Abulhair Saparov,Vijay Saraswat和Tom M.Mitchell。 2017.语义解析的概率生成语法。在第21届计算自然语言学习会议(CoNLL 2017)的会议记录中。 依存关系 要使用代码,只需下载文件并使用make datalog_to_lambda或make p
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-21
文件大小:377856
提供者:
weixin_42144086
BetterEnd:更好的MC MC-源码
更好的结局 织物的更好端部调制,MC 1.16.4 输入: 克隆回购 如有必要,编辑gradle.properties 在文件夹中运行命令行:gradlew genSources eclipse(或Another-IDE-Name) 将项目导入到IDE 建筑: 克隆回购 在文件夹中运行命令行:gradlew build Mod .jar将位于./build/libs中 映射:
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-19
文件大小:69206016
提供者:
weixin_42126749
sumu-源码
苏木 用于处理概率和因果图形模型的Python库。 由赫尔辛基大学的开发。 :warning:当前状态下的库在很大程度上仍在进行中。 该图书馆旨在促进: 学术工作流,通过模块化访问高度优化的低级算法。 工业工作流程,通过使用针对定义明确的实际用例的低级组件提供易于使用的包装器。 可以在上找到文档。 要求 Sumu经过测试可与Python 3.6、3.7和3.8版本一起使用。如果要在R中使用该库,请按照进行安装后,在R中 。 安装 $ pip install sumu 有关更多详细信息,请参阅
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-18
文件大小:205824
提供者:
weixin_42144604
blangSDK:Blang的软件开发套件-源码
概括 潜在/当前用户:请访问以获取更多信息。 Blang开发人员:除了上述资源外,请参阅以获取更多信息。 这是托管Blang代码的存储库之一。这其中包含Blang的SDK(软件开发套件),其中包括: 适用于采样的基本数据类型。 创建新数据类型和分布的基础结构。 此类数据类型的推理算法,例如和测量顺序变化。 标准概率分布。 MCMC测试基础架构。 运行时执行静态分析以推断因子图及其稀疏性模式。 自动化的后处理设施(MCMC诊断,跟踪/密度/ pmf /摘要生成等)。 有关其他关键存储库(语言基
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-18
文件大小:2097152
提供者:
weixin_42117116
stantargets:具有目标和cmdstanr的可重现贝叶斯数据分析管道-源码
stantargets stantargets R软件包是对Bayesian数据分析的和的扩展。 stantargets使得设置有用的可扩展Stan管道变得非常容易,该管道可自动并行化计算并在结果已为最新时跳过昂贵的步骤。需要最少的自定义代码,并且不需要手动配置分支,因此使用比单独使用容易得多。 stantargets可以访问的所有主要算法(MCMC,变分贝叶斯算法和优化),并且支持单拟合工作流和多重复仿真研究。 先决条件 的。 基本了解 :观看6至40分钟,然后阅读。 熟悉贝叶斯统计和。事先
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-18
文件大小:439296
提供者:
weixin_42122881
qpbrute:拟合qpGraph模型的启发式搜索算法-源码
qpBrute 该存储库包含用于自动拟合混合图(带有 ),使用启发式算法来迭代拟合日益复杂的模型的Python代码,以及用于计算贝叶斯因子(带有 )以比较拟合模型的R代码。 该启发式搜索算法首先”一文中进行了描述。 该代码随后被重构以形成一个独立的工具,包括贝叶斯因子计算,该论文。 给定一个用于生成图的外部组,使用逐步添加顺序算法将叶节点添加到图。 在每个步骤中,都会在图的所有分支(外组分支除外)上测试新节点的插入。 如果无法插入节点而不产生f4离群值(即| Z |> = 3),那么
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-18
文件大小:2097152
提供者:
weixin_42131443
DS_Projects:数据科学项目集合-源码
应用数据科学Capstone产品组合 你好! 此回购包含了一系列材料(脚本,报告,图形等),这些材料展示了我最近的工作的一部分。 下面的每个部分都提供了有关回购中的工件的一些详细信息。 以下是过去几年中我一直在使用的工具和技术的示例。 这是一个非常粗略的草稿,并将在接下来的几个月中进行更新。 使用的工具 工具 使用权 土坯 竞技场模拟 电子表格 插画家 迷你标签 橘子 Power BI Python [R 火花 SQL 斯塔塔 画面 威卡 使用的技巧 技巧 人工神经网络/深度学习 方差分
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-17
文件大小:22020096
提供者:
weixin_42137539
elfi:ELFI-无可能性推理引擎-源码
版本0.7.7已发布! 请参阅和。 注意:目前,NetworkX 2与ELFI不兼容。 ELFI-无可能性推理引擎 ELFI是一个用Python编写的统计软件包,用于无近似推理(LFI),例如近似贝叶斯计算( )。 术语LFI是指一系列推论方法,这些推论方法将似然函数的使用替换为数据生成模拟器函数。 ELFI具有易于使用的生成建模语法,并支持开箱即用的并行推理。 当前实施的LFI方法: ABC拒绝采样器 顺序蒙特卡洛ABC采样器 带有SMC-ABC采样器 SMC-ABC采样器 其他值
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-17
文件大小:244736
提供者:
weixin_42178963
project1-源码
专案1 集成嵌套拉普拉斯近似(INLA)是一种功能强大的贝叶斯推断方法。 它将后验积分分解为低维积分的嵌套乘积,这使其适用于MCMC太慢的高维复杂模型。 最近,INLA已成功用于预测足球比赛的结果。 该项目的目的是探索国际橄榄球联盟的基本思想,并实施一些复杂程度不断提高的模型来预测足球比赛的结果。
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-17
文件大小:1048576
提供者:
weixin_42116921
arginfer:推断祖先重组图-源码
ARGinfer arginfer是推断祖先重组图(ARG)的概率方法。 该方法使用马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)和合并后的ARG的后分布样本以及突变的先验和无限位点重组模型。 请参阅以获取有关安装和使用该软件的信息。
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-17
文件大小:6291456
提供者:
weixin_42134240
mcmc-monitor:监视MCMC运行-源码
MCMC监控器 基于浏览器的MCMC运行监视。 安装与设定 第一个示例:多正常Stan 随着kachery守护程序和Web应用程序的运行,您现在可以尝试运行第一次MCMC。 在安装过程中创建的conda环境中运行以下命令: python examples/multi_normal_example/multi_normal_example.py 采样开始几秒钟后,新的运行应出现在Web浏览器的工作区中。 单击该按钮可实时监视MCMC采样的进度和收敛。 用法示例 with MCMCMonitor
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-17
文件大小:349184
提供者:
weixin_42109545
withinhost-源码
分析宿主体内HIV表面蛋白的插入/缺失(插入/缺失)突变 该项目包含部分(不是全部)脚本,这些脚本用于生成我的硕士论文中呈现的结果。 就背景而言,gp120蛋白存在于HIV表面,负责使HIV进入并感染我们自己的身体细胞。 该管道用于获取约25,000个HIV基因序列,对其进行处理,使用MCMC /贝叶斯推理来重建进化历史(系统树),并对indel突变的速率进行建模(Hamiltonian Monte Carlo; RStan;分层建模)。
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-16
文件大小:890880
提供者:
weixin_42107491
MCMC-源码
马尔可夫链蒙特卡洛 我从头开始实现Python中的Metropolis-Hastings算法,以查找虚拟数据示例的参数分布,然后找到现实世界中的问题。 我将仅使用numpy来实现该算法,并使用matplotlib来呈现结果。 可以在需要时使用Scipy计算密度函数,但我还将展示如何使用numpy来实现它们。 MH-Gibbs已添加到此仓库中。
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-16
文件大小:5242880
提供者:
weixin_42137539
MCMC.jl:Julia中的MCMC-源码
MCMC文件 Julia的MCMC。
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-27
文件大小:17408
提供者:
weixin_42171208
mcmc-ks:ゼロからできるMCMC-源码
mcmc-ks ゼロからできるMCMC
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-16
文件大小:69632
提供者:
weixin_42138376
parallel-mcmc-spatial-partitioning:具有空间分区的并行色域MCMC-源码
并行mcmc空间分区 “具有空间分区的并行色MCMC”的代码
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-12
文件大小:693248
提供者:
weixin_42099814
mcmc-源码
mcmc
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-09
文件大小:587776
提供者:
weixin_42102358
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