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Loris-MRI:预处理脚本并将MRI数据插入数据库的脚本集-源码
本自述文件涵盖适用于Ubuntu或CentOS系统的LORIS Imaging插入管道的22.0。*版。 此存储库与(版本22.0。*)一起提供。 有关文档和详细的设置信息,请参阅所安装版本的。 该存储库可以安装在与主LORIS代码库相同的VM上,也可以安装在其他计算机上,例如用于存储大型映像文件集的指定文件服务器。 系统要求 Perl 带有pip3和virtualenv的Python 3(下面的步骤2) MINC工具包(下面的步骤3) DICOM工具包(下面的步骤4) tpcclib
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-25
文件大小:2097152
提供者:
weixin_42116701
bidscoin:BIDScoin将您的源级神经影像数据转换为BIDS-源码
BIDScoin:将您的影像数据硬币到BIDS BIDScoin是一种用户友好python工具包,可将(“硬币”)源级(原始)神经影像数据集转换为按照Brain Imaging数据结构(又称为标准)组织的 / / 数据集。 。然后,BIDScoin依靠复杂或模棱两可的程序逻辑来识别成像模态,而是使用映射方法来识别原始源数据并将其转换为BIDS数据。通过从MRI头文件(DICOM或PAR / REC;例如ProtocolName )中读取信息来识别源数据的不同运行,并且研究人员可以事先指定或
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-22
文件大小:3145728
提供者:
weixin_42113552
tg-toolset-golang:Go工具和库,用于与TG管理的各种服务进行交互-源码
TG工具集golang CLI工具和交互和管理由DCCN技术小组,写在提供的各种ICT服务可重用库 。 代码结构 当前,整个软件包分为三个主要部分,每个部分都提供了一套CLI工具。 他们是: 包含用于自动MEG / MRI数据流的工具和库。 :用于从日历系统中检索实验室预订事件的CLI。 在MEG控制台上使用它来提供信息,以用于构造项目存储中的MEG原始数据。 :从Orthanc PACS服务器检索MRI研究的CLI。 :用于(重新)从Orthanc PACS服务器流式传输数据的
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-16
文件大小:129024
提供者:
weixin_42164702
direct:用于图像重建的深度学习框架-源码
直接的 DIRECT是Deep Image重建工具包,它实现了最新的逆问题解决程序。 它包括反向问题解决器,例如Learned Primal Dual算法和递归推理机,它们是Facebook和NYU在2019年的FastMRI挑战赛中获胜的解决方案以及在MIDL 2020年的Calgary-Campinas MRI重建挑战赛中获奖的解决方案的一部分。 安装 请参阅 。 快速开始 请参阅 ,查看。 在文件夹中,提供了有关如何在公共数据集上训练模型的示例。 基线和训练有素的模型。 我们在提供了一组
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-07
文件大小:39845888
提供者:
weixin_42120563
MRI工具包-源码
[更新 ] 此版本的新功能: 将代码重新组织为两个主要类别:MRTQuant(预处理/ DTI / DKI)和MRTrack(与术式相关) 支持自动光纤群集(请参阅下面的参考资料) 早期支持与Python集成(需要以上几点) 支持VTK多边形数据4.2和5.1(集群也需要) 为GRL / mFOD反卷积添加了可靠的选项 最初支持存储NIFTI Q / S表单(以提高与尚未使用的其他工具的互操作性) 与CAT12集成 它是什么? MRIToolkit是一组和一个MATLAB(R)工
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-26
文件大小:5242880
提供者:
weixin_42099116
MLM:神经影像数据的多变量分析-源码
传销 神经影像数据的多变量分析。 多元方法。 通用多元工具。 包含探索MRI或PET数据的不同过程。使用MM软件包的标准方法是首先执行标准spm分析,这将提供第一个先验模型以及相应的估计参数和正方形图像的残差和。 由于选择的时间滤波器或标准化很重要,因此请记住用于有意义地解释MM结果的参数。 MM嵌入了几个空间空间的概念,因此,如果对几个主题(1..N)或感兴趣的区域具有相同的时间空间分别执行回归模型,则MM允许您将数据视为维度共同的矩阵, time-dim X(subject1-space-
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-18
文件大小:121856
提供者:
weixin_42131728
NiftyMIC:NiftyMIC是研究重点集中的工具包,用于二维超快MRI的运动校正和体积图像重建-源码
二维超快MRI的运动校正和体积图像重建 NiftyMIC是一个基于Python的开源工具包,用于项目中开发的研究,目的是从多个可能运动受损的低分辨率2D切片堆栈中重建各向同性高分辨率体积。 该框架依靠切片到卷的配准算法进行运动校正,并使用基于重建的超分辨率(SR)技术进行体积重建。 该算法和软件是由 ( 的 (自2019年起)。 所述NiftyMIC算法的详细描述中发现 : Ebner,M.,Wang,G.,Li,W.,Aertsen,M.,Patel,PA,Aughwane,R.,Mel
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-10
文件大小:15728640
提供者:
weixin_42119358
tty-screen:终端屏幕检测-跨平台,主要的Ruby解释器-源码
TTY ::屏幕 终端屏幕尺寸检测,可在Linux,OS X和Windows / Cygwin平台上运行,并支持MRI,JRuby,TruffleRuby和Rubinius解释器。 TTY :: Screen为工具包提供了独立的终端屏幕尺寸检测组件。 安装 将此行添加到您的应用程序的Gemfile中: gem 'tty-screen' 然后执行: $ bundle 或自己安装为: $ gem install tty-screen 1.用法 TTY :: Screen允许您通过调用返回
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-06
文件大小:19456
提供者:
weixin_42113794
DCEMRI.jl:Julia中的DCE MRI分析-源码
DCEMRI检查 快速,经过验证的开放源代码工具包,用于动态对比度增强MRI分析 为什么是Julia? 在, Julia是用于技术计算的高级,高性能动态编程语言,其语法为其他技术计算环境的用户所熟悉。 它提供了完善的编译器,分布式并行执行,数值精度和广泛的数学函数库。 该库主要用Julia本身编写,还集成了成熟的,最好的C和Fortran库,用于线性代数,随机数生成,信号处理和字符串处理。 简而言之,它看起来像Matlab,对于大多数MRI研究人员来说,它很容易学习和熟悉,但是它工作得更好
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-04
文件大小:4194304
提供者:
weixin_42119358
诊所:用于临床神经影像研究的软件平台-源码
诊所 临床神经影像学研究软件平台 | | 另请参阅: , 关于该项目 Clinica是一个用于临床研究的软件平台,涉及神经病和精神病患者以及多模式数据(神经影像学,临床和认知评估,遗传学...)的获取,大多数情况下是进行纵向随访。 Clinica是命令行驱动的,并使用Python编写。 它使用系统进行流水线处理,并结合了用于神经影像数据分析( , , , , , ),机器学习( )和用于数据组织的广泛使用的软件包。 Clinica提供了将公共可用的神经影像数据集转换为BI
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-02
文件大小:3145728
提供者:
weixin_42108054
ITK:Insight工具包(ITK)-官方存储库。 ITK建立在经过验证的,面向空间的体系结构上,用于在两个,三个或更多个维度上处理,分割和配准科学图像-源码
ITK:洞察力工具包 C ++ Python Linux 苹果系统 视窗 Linux(代码覆盖率) 链接 关于 Insight工具包(ITK)是用于N维科学图像处理,分割和配准的开源,跨平台工具包。 细分是对数字采样表示中的数据进行识别和分类的过程。 通常,采样的表示是从诸如CT或MRI扫描仪之类的医疗仪器获取的图像。 注册是在数据之间对齐或建立对应关系的任务。 例如,在医学环境中,CT扫描可以与MRI扫描对齐,以便合并包含在两者中的信息。 ITK项目使用,由财政资助。 考虑进行以帮
所属分类:
其它
发布日期:2021-01-30
文件大小:31457280
提供者:
weixin_42166626