指标-CGM-ECC 合并了两个单独项目的工作（可以在以下位置找到初始合并之前的状态： : 和 ） 要收集结果，请在终端中运行以下命令： Rscr ipt环境_设置.R 这将安装环境中未找到的所有必需的R软件包，并检查是否可以正确加载它们。它还会将占位符源距离文件写入input / processed /目录，如果您有要使用的源数据，则可以覆盖该占位符。 如果对样本数据运行此过程，请运行 Rscr ipt prepare_inputs.R 否则，将您（正确格式化的）输入文件移动到inputs