单分子印迹 介绍 SingleMoleculeFootprinting是围绕构建的R软件包，专门用于分析单分子足迹（SMF）数据。 SMF是在开发的一种高通量测序技术。 它包括使用外源甲基转移酶在GpC和CpG环境中标记可及的基因组胞嘧啶，以及随后进行的亚硫酸氢盐测序（BS）。 因此，受DNA相互作用蛋白（例如TF，核小体，GTF等）结合保护的胞嘧啶将被甲基化，而可及的胞嘧啶将被甲基化。 使用本程序包，我们提供了从对齐的bam文件到单个站点结果的生物学解释，执行基本SMF数据分析的功能。 前