cLoops：ChIA-PET，Hi-C，HiChIP和Trac循环的循环调用 介绍 染色体构象捕获（3C）衍生的高通量测序方法（例如ChIA-PET，HiChIP和Hi-C）提供了染色质组织的全基因组视图。 从这些数据中可以检测到跨越数百千碱基的调节元素相互作用形成的精细环。 在这里，我们介绍了cLoops（“查看循环”），这是一种用于ChIA-PET，HiChIP和高分辨率Hi-C数据的通用循环调用工具。 配对末端标签（PET）首先使用优化的无监督聚类算法分类为自连接和连接间聚类。 然后使用