MetaWorks的
MetaWorks由一个conda环境和Snakemake流水线组成,这些流水线将在命令行中运行,以生物信息学方式处理从原始读取到分类分配的Illumina配对末端元条形码。 MetaWorks当前支持许多流行的标记基因扩增子和元条形码:COI(真核生物),rbcL(真核生物,硅藻),ITS(真菌,植物),16S(原核生物),18S(真核生物,硅藻),12S(鱼)和28S(真菌)。 使用RDP分类器进行分类分配,该分类器使用朴素的贝叶斯方法来生成分类分配,并在每个等级上提供