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  1. etrf:精确的串联重复查找器(不是TRF替代品)-源码

  2. Etrf是一种简单的工具,可找到DNA序列中的精确串联重复序列(即重复单元中没有错配或缺口)。 它只有两个参数:最大重复单元长度和最小总重复长度。 对于每个单位长度,etrf扫描输入序列并获得不少于单位长度两倍的非重叠区域列表。 对于以不同单位长度标识的两个重叠区域,etrf选择较长的区域,或者,如果两个区域的长度相等,则选择找到的单位长度较短的区域。 无法找到不正确的串联重复序列,etrf不能替代更复杂的工具,例如或 。 但是,由于etrf实现了精确的算法,因此它避免了重复定义的歧义,并且其
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2021-03-09
    • 文件大小:8192
    • 提供者:weixin_42139871