此软件用于calling SNP， 已经打包成zip，解压了之后可以直接用。

freebayes, 基于贝叶斯单体的遗传多态性 freebayes，一种基于单体型的变种检测器用户手册和指南 [Gitter](https://badges.gitter.im/Join chat 。svg )!概述基于基因序列的基因变异检测器是一种用于发现小多态性，特别是

棘皮动物 Snakemake中可重复使用的，全面的，有思想的工厂变体调用管道 关于作者 这是在， 和之间开发的数条管道的合并。 合并是由KD Murray博士撰写的，KD Murray，Norman Warthmann和Ilja Bezrukov编写了原始代码，并在上述机构中获得了许多其他贡献。 去做： 将更多freebayes参数分解到配置文件中

介绍 这是一个管道的存储库，该管道是为对的降采样数据集进行变体调用而编写的。 下采样的数据集由仅映射到20号染色体的读段组成。 管道使用两个工具调用变量，稍后将比较它们的最终输出： bcftools FreeBayes 两种工具的输出均保存到单独的文件中。 在这一点上，管道分叉成两个平行的轨道，一个轨道用于每个工具的输出。 以下说明适用于两条轨道： 调用变体后，将根据变体质量和变体现场的深度来过滤变体（来自两个工具）。 此外，它们被过滤为仅包含SNP，而没有其他类型的变异，如插入缺失