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jcmDNAtools:基于pythonpandas的实用程序,用于分析高通量DNA测序数据-源码
DNA分类器 我将NLP分类器代码与生物信息学代码结合在一起,以识别参考基因组中重复出现的DNA图案,并训练神经网络在两个样本之间进行分类。 1.learnMotifs.py研究了两个参考基因组并确定了指定长度的前100个重复基序 2.tokenizeFastQ.py适用于fastA或fastQ原始数据格式,并使用1中的主题对其进行标记化 3.trainDNAclassifier.py接受来自2的标记化数据,并训练神经网络在两者之间进行分类。 这提供了程序上可扩展的数据管道,可以直接从Ill
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发布日期:2021-02-21
文件大小:14680064
提供者:
weixin_42131890