scGEAToolbox-用于单细胞RNA序列数据分析的Matlab工具箱
介绍
动机:单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术彻底改变了生物医学科学领域的研究方法。它为研究细胞异质性和基因表达变异性提供了单个细胞前所未有的分辨率。由于数据的稀疏性和高维性,因此分析scRNA-seq数据具有挑战性。结果:我开发了scGEAToolbox —一种用于scRNA-seq数据分析的Matlab工具箱。它包含用于数据归一化,功能选择,批处理校正,插补,单元格聚类,轨迹/伪时间分析和网络构建的一整套功能