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搜索资源 - modimizer:使用新型缩减型kmer进行快速DNA读集匹配和组装的工具集-源码
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modimizer:使用新型缩减型kmer进行快速DNA读集匹配和组装的工具集-源码
修改器 使用简单的kmer采样方法进行快速,节省空间的DNA读集匹配和组装的工具集。 具有精确kmer匹配的种子序列比对是DNA序列匹配和数据集分析的许多生物信息学方法的关键组成部分。 存在用于快速枚举读取集的所有kmers的工具,但是将它们全部表示在内存中的开销很大。 快速访问的自然工具是哈希表,但这可能会占用更多空间。 最近,已经引入了minhash和最小化方法,这些方法仅通过使用kmer的子集来节省速度上的空间。 对于这些方法,基于它们的哈希值相对于集合中的其他值较低(minhash)还
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-16
文件大小:68608
提供者:
weixin_42162216