rna_seq 概述： 使用和进行比对的RNA-Seq管线（如果是后者则为伪比对）。 参数： -a | --aligner-to-use -a | --aligner-to-use ：如果要使用Kallisto，则指定1如果要使用HISAT2，则指定2 。 默认值：Kallisto -i | --input-files-directory -i | --input-files-directory ：输入包含FASTQ文件的目录的路径。 -r | --reference-index -r |

输出 github_document MuRD：通过整合来自单细胞参考和外部表达数据的信息，对大RNA测序数据进行多鲁棒细胞型反褶积 MuRD统一了多种解卷积方案，可从目标大量RNA-seq数据推断细胞类型比例。 该算法具有三个独特的功能：首先， MuRD能够整合来自外部数据源的额外生物学信息（例如，来自独立研究的scRNA_seq和其他大量RNA_seq数据）； 其次， MuRD通过考虑基于参考的方法的比例估计来校准无参考算法； 第三， MuRD对于来自任何提供的数据源的错误信息具有鲁棒性。