RNAlign2D RNAlign2D是一种Python包装器，它允许使用有关二级结构和序列的信息来比对多个RNA分子。 为此，使用了MUSCLE程序，但可以对其进行调整以使用任何其他多序列比对工具。 该工具首先去除常见的RNA修饰，然后将RNA序列和二级结构转换为假氨基酸序列（请不要误解翻译过程-这只是技术解决方案），然后使用MUSCLE来比对假氨基酸序列。 最后恢复过程，并恢复与原始序列和二级结构的比对。 点括号格式 格式，成对残基标记为方括号（），未成对残基标记为点。 例如，包含发夹的