可持续发展 通过ONT测序生成共识文件.fasta文件并识别穿山甲谱系和Sars-CoV-2基因组的下一个菌株的管道。 该管道将​​名称为的文件夹作为输入，其中包含来自Sars-CoV-2 ONT测序的文件夹fast5_pass和fast5_pass以及fastq_pass sequencing_summary*.txt以及链接条形码和样品名称的CSV文件，并以及_report.csv ，其中包括， 和 。 安装 使用susCovONT/scr ipts/install.sh安装所有必要的工具和