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tempoSig:使突变目录最适合签名-源码
速度信号 使用最大似然和贝叶斯NMF进行突变签名提取 概述 tempoSig在一组已知的输入签名列表(重新设置)下实现了基于最大似然的一组突变计数数据的突变签名比例的提取。 此外,它还包括基于贝叶斯非负矩阵分解的从头提取,从而可以确定最可能的签名数。 重组的基本算法与算法相同,但是此处在R / C ++中重新实现可大幅提高约100倍的速度。 这种加速可以通过基于置换的采样来快速估计p值。 基本对象(S4类)可以存储输入数据,参考签名列表,样本的输出曝光量和p值。 还包括用于绘图和文件输出的实用
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-14
文件大小:1048576
提供者:
weixin_42144201