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搜索资源 - trfermikit:发现使用Illumina读取很难找到的VNTR相关DEL-源码
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trfermikit:发现使用Illumina读取很难找到的VNTR相关DEL-源码
动机 短读呼叫者错过的大多数SV串联重复: (基于补充数据53和与Mark Chaisson的私人通信)。 这一发现促使我们尝试发现串联重复的新型SV。 范围 由于存在呼叫者来捕获重复单元小于6bps的串联重复序列中的SV(在社区中称为短串联重复序列(STR)),因此我们设计了trfermikit来拾取重复单元大于6bps的串联重复中缺少manta的SV,称为可变数字串联重复(VNTR)。 影响 在这两种情况下,相对于长期阅读的基准通话集,我们在VNTR上评估了trfermikit和manta
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-24
文件大小:13631488
提供者:
weixin_42107374