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搜索资源列表

  1. 生物系统发育树的图形化显示软件

  2. 生物系统发育树的图形化显示软件 着重研究系统发育树(进化树)的描述方法、进化树表示的Newick格式(一种嵌套结构的文本)、运用栈的数据结构与算法于自动解析文本描述的进化树拓扑结构、以及进化树的图形编程实现技术等。
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2010-03-16
    • 文件大小:959488
    • 提供者:cnayr
  1. 生物信息学软件用于序列比对和系统发育树构建

  2. 生物信息学软件,MEGA,molecular evolution genetics analysis,分子生物进化遗传分析工具,用于生物信息学序列比对,和系统发育树构建
  3. 所属分类:教育

    • 发布日期:2011-05-20
    • 文件大小:8388608
    • 提供者:yangxiao985
  1. 生物统计学软件用于构建系统发育树

  2. 生物信息学软件,用于构建系统发育树等信息.在生物信息学领域有重要应用和使用价值
  3. 所属分类:教育

    • 发布日期:2011-05-20
    • 文件大小:959488
    • 提供者:yangxiao985
  1. 16SrDNA序列对细菌进行系统发育树

  2. 16S rDNA序列分析法制作系统发育树
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2013-08-29
    • 文件大小:88064
    • 提供者:u011877921
  1. 一株野生细菌的16SrDNA序列分析与系统法约束的构建

  2. 野生细菌利用16SrDNA法系统发育树构建
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2013-08-29
    • 文件大小:90112
    • 提供者:u011877921
  1. 系统发育树

  2. 系统发育树构建的i型昂昂。aln文件格式
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2013-12-22
    • 文件大小:169984
    • 提供者:u013244088
  1. 系统发育树构建方法

  2. 系统发育树构建方法,讲解请详细,可以帮助生物学人学习系统发育树的构建
  3. 所属分类:专业指导

    • 发布日期:2014-03-20
    • 文件大小:1048576
    • 提供者:u014250677
  1. MEGA软件 系统发育树构建方法(图文讲解)

  2. 此文件为MEGA软件的使用教程,简明、清晰、使用图文的方式讲解系统发育树构建方法,为生物学相关专业使用
  3. 所属分类:讲义

    • 发布日期:2014-08-07
    • 文件大小:1048576
    • 提供者:sinat_19064035
  1. 使用PhyML构建系统发育树

  2. 使用PhyML构建系统发育树,将后缀名改成 trees 之后可以使用 treeview 等软件查看结果树
  3. 所属分类:专业指导

    • 发布日期:2015-03-05
    • 文件大小:142336
    • 提供者:qq_26337005
  1. 发育树构建6

  2. 用以编辑序列数据、序列比对、构建系统发育树,推测物种间进化距离
  3. 所属分类:医疗

    • 发布日期:2018-03-10
    • 文件大小:40894464
    • 提供者:qq_41816318
  1. mega画系统发育树

  2. 16S基因片段组装,在NCBI中进行Blast比对,利用下载的序列在mega绘制进化树,多组图片作为详解!
  3. 所属分类:讲义

    • 发布日期:2018-05-17
    • 文件大小:15728640
    • 提供者:vivianzzc
  1. 基于28S rDNA和COI基因的反颚茧蜂亚科9属系统发育关系研究(膜翅目:茧蜂科)

  2. 基于28S rDNA和COI基因的反颚茧蜂亚科9属系统发育关系研究(膜翅目:茧蜂科),黄珺,陈家骅,本文基于28S rDNA和COI基因序列,以最大似然法(ML)和最大简约法(MP)构建分子发育树,探讨反颚茧蜂亚科9属之间的系统发育关系。反�
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2020-02-13
    • 文件大小:395264
    • 提供者:weixin_38702110
  1. 浅谈系统发育分析及进化树制作.ppt

  2. 系统发育分析是研究物种进化和系统分类的一种方法,研究对象为携带遗传信息的生物大分子序列,采用特定的数理统计算法来计算生物间的生物系统发生的关系。并用系统进化树来概括生物间的这种亲缘关系。
  3. 所属分类:讲义

    • 发布日期:2020-02-03
    • 文件大小:3145728
    • 提供者:qq_20389113
  1. phyloweb:Web应用程序,使用登录号作为输入并使用RAxML进行树推断来推断系统树-源码

  2. Phyloweb Phyloweb是一个Web应用程序,用于基于登录号创建系统发育树。 这分3个步骤执行: 使用Entrez从NCBI服务器检索序列 使用Clustal Omega或MAFFT进行多序列比对 使用RAxML推断系统树 先决条件: Python 3.x conda 设定说明 为了设置应用程序,您需要安装conda。 使用以下方法创建环境: conda create -n phyloweb -c conda-forge -c bioconda snakemake pyth
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2021-03-16
    • 文件大小:475136
    • 提供者:weixin_42103128
  1. ncp-group1:用于储存病毒系统发育树相关的代码和数据-源码

  2. ncp-group1 用于储存病毒系统发育树相关的代码和数据 一组:2019-nCoV系统发育分析与微进化研究 数据来源: 基因组序列数据库: (登录号NMDC10013002和基因组登录号NMDC60013002-01至NMDC60013002-10) (登录号CNA0007332–35) 软件工具: 序列比对 爆破 构建进化树 激光基因7.0 巨型6.0 菲利普 评估分子进化率 FUBAR:快速无约束贝叶斯近似 研究方案 1.基因组序列下载 姓名 来源 数据库(ID) 序列长度 下载
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2021-03-11
    • 文件大小:8388608
    • 提供者:weixin_42162216
  1. tree2graph:将系统发育树转换为图并将其合并为最终图-源码

  2. tree2graph 将系统发育树转换为图并将其合并为最终图 用法: newickTree_2_CytoscapeLink.pl:转换树(newick格式)以链接信息; treeLinks_merge.pl:合并多棵树的链接信息; generate_nodeSize.pl:根据登录和共同祖先的出现次数生成不同大小的节点; 使用Cytoscape可视化图形。
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2021-03-10
    • 文件大小:129024
    • 提供者:weixin_42116672
  1. 基于H曲线距离的DNA序列的系统发育树。

  2. 本文提出了用H曲线来表示线粒体DNA序列,通过H曲线压缩定义距离,H曲线均值定义距离和H曲线点差定义距离等方法计算DNA序列间距离相似矩阵,发生树。
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2021-03-09
    • 文件大小:125952
    • 提供者:weixin_38502183
  1. 女皇:用于微生物组数据分析的快速,可扩展的系统树浏览器-源码

  2. 皇后 介绍 Empress是一种快速且可扩展的浏览器,可帮助交互式地探索数据集中要素之间的层次关系。 从历史上看,这些特征通常在社区调查中代表物种的进化关系,并以它们的系统发育或遗传相似性/差异为特征,但实际上,您可以按层级组织查看任何类型的信息。 例如,您可以查看从16S rRNA标记基因测序数据生成的树,或使用 ( )LC-MS数据的代谢树。 Empress支持分类的新功能,例如动画和与排序图的集成,以及已建立的树查看器共有的功能(例如,元数据着色,分支折叠和条形图)。 截屏 “帝国
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2021-02-18
    • 文件大小:7340032
    • 提供者:weixin_42110070
  1. ab12phylo:AB12PHYLO:易于使用的集成应用程序,用于ML系统发育树推断-源码

  2. AB12PHYLO 是一个集成的,易于使用的管道,用于根据ABI测序数据推断最大似然(ML)系统树。 AB12PHYLO的核心是运行并行实例(Kozlov等,2019),并在参考数据库中进行BLAST搜索。 它基于系统发生的位置和序列相似性,实现直观,轻松的样品识别,并借助Tajima D等指标对种群子集进行选择,以评估正在进行的进化。 开发AB12PHYLO来鉴定植物病原体种群,可能是通过与茄属的平衡选择,尤其是在链格孢菌(Alternaria)中。 尽管全基因组测序的兴起,尽管多基因系统
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2021-02-15
    • 文件大小:10485760
    • 提供者:weixin_42143092
  1. ggtree:系统发育树的可视化和注释-源码

  2. ggtree:系统发育树的可视化和注释
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2021-02-05
    • 文件大小:365568
    • 提供者:weixin_42131414
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