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生物系统发育树的图形化显示软件
生物系统发育树的图形化显示软件 着重研究系统发育树(进化树)的描述方法、进化树表示的Newick格式(一种嵌套结构的文本)、运用栈的数据结构与算法于自动解析文本描述的进化树拓扑结构、以及进化树的图形编程实现技术等。
所属分类:
其它
发布日期:2010-03-16
文件大小:959488
提供者:
cnayr
生物信息学软件用于序列比对和系统发育树构建
生物信息学软件,MEGA,molecular evolution genetics analysis,分子生物进化遗传分析工具,用于生物信息学序列比对,和系统发育树构建
所属分类:
教育
发布日期:2011-05-20
文件大小:8388608
提供者:
yangxiao985
生物统计学软件用于构建系统发育树
生物信息学软件,用于构建系统发育树等信息.在生物信息学领域有重要应用和使用价值
所属分类:
教育
发布日期:2011-05-20
文件大小:959488
提供者:
yangxiao985
16SrDNA序列对细菌进行系统发育树
16S rDNA序列分析法制作系统发育树
所属分类:
其它
发布日期:2013-08-29
文件大小:88064
提供者:
u011877921
一株野生细菌的16SrDNA序列分析与系统法约束的构建
野生细菌利用16SrDNA法系统发育树构建
所属分类:
其它
发布日期:2013-08-29
文件大小:90112
提供者:
u011877921
系统发育树
系统发育树构建的i型昂昂。aln文件格式
所属分类:
其它
发布日期:2013-12-22
文件大小:169984
提供者:
u013244088
系统发育树构建方法
系统发育树构建方法,讲解请详细,可以帮助生物学人学习系统发育树的构建
所属分类:
专业指导
发布日期:2014-03-20
文件大小:1048576
提供者:
u014250677
MEGA软件 系统发育树构建方法(图文讲解)
此文件为MEGA软件的使用教程,简明、清晰、使用图文的方式讲解系统发育树构建方法,为生物学相关专业使用
所属分类:
讲义
发布日期:2014-08-07
文件大小:1048576
提供者:
sinat_19064035
使用PhyML构建系统发育树
使用PhyML构建系统发育树,将后缀名改成 trees 之后可以使用 treeview 等软件查看结果树
所属分类:
专业指导
发布日期:2015-03-05
文件大小:142336
提供者:
qq_26337005
发育树构建6
用以编辑序列数据、序列比对、构建系统发育树,推测物种间进化距离
所属分类:
医疗
发布日期:2018-03-10
文件大小:40894464
提供者:
qq_41816318
mega画系统发育树
16S基因片段组装,在NCBI中进行Blast比对,利用下载的序列在mega绘制进化树,多组图片作为详解!
所属分类:
讲义
发布日期:2018-05-17
文件大小:15728640
提供者:
vivianzzc
基于28S rDNA和COI基因的反颚茧蜂亚科9属系统发育关系研究(膜翅目:茧蜂科)
基于28S rDNA和COI基因的反颚茧蜂亚科9属系统发育关系研究(膜翅目:茧蜂科),黄珺,陈家骅,本文基于28S rDNA和COI基因序列,以最大似然法(ML)和最大简约法(MP)构建分子发育树,探讨反颚茧蜂亚科9属之间的系统发育关系。反�
所属分类:
其它
发布日期:2020-02-13
文件大小:395264
提供者:
weixin_38702110
浅谈系统发育分析及进化树制作.ppt
系统发育分析是研究物种进化和系统分类的一种方法,研究对象为携带遗传信息的生物大分子序列,采用特定的数理统计算法来计算生物间的生物系统发生的关系。并用系统进化树来概括生物间的这种亲缘关系。
所属分类:
讲义
发布日期:2020-02-03
文件大小:3145728
提供者:
qq_20389113
phyloweb:Web应用程序,使用登录号作为输入并使用RAxML进行树推断来推断系统树-源码
Phyloweb Phyloweb是一个Web应用程序,用于基于登录号创建系统发育树。 这分3个步骤执行: 使用Entrez从NCBI服务器检索序列 使用Clustal Omega或MAFFT进行多序列比对 使用RAxML推断系统树 先决条件: Python 3.x conda 设定说明 为了设置应用程序,您需要安装conda。 使用以下方法创建环境: conda create -n phyloweb -c conda-forge -c bioconda snakemake pyth
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-16
文件大小:475136
提供者:
weixin_42103128
ncp-group1:用于储存病毒系统发育树相关的代码和数据-源码
ncp-group1 用于储存病毒系统发育树相关的代码和数据 一组:2019-nCoV系统发育分析与微进化研究 数据来源: 基因组序列数据库: (登录号NMDC10013002和基因组登录号NMDC60013002-01至NMDC60013002-10) (登录号CNA0007332–35) 软件工具: 序列比对 爆破 构建进化树 激光基因7.0 巨型6.0 菲利普 评估分子进化率 FUBAR:快速无约束贝叶斯近似 研究方案 1.基因组序列下载 姓名 来源 数据库(ID) 序列长度 下载
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-11
文件大小:8388608
提供者:
weixin_42162216
tree2graph:将系统发育树转换为图并将其合并为最终图-源码
tree2graph 将系统发育树转换为图并将其合并为最终图 用法: newickTree_2_CytoscapeLink.pl:转换树(newick格式)以链接信息; treeLinks_merge.pl:合并多棵树的链接信息; generate_nodeSize.pl:根据登录和共同祖先的出现次数生成不同大小的节点; 使用Cytoscape可视化图形。
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-10
文件大小:129024
提供者:
weixin_42116672
基于H曲线距离的DNA序列的系统发育树。
本文提出了用H曲线来表示线粒体DNA序列,通过H曲线压缩定义距离,H曲线均值定义距离和H曲线点差定义距离等方法计算DNA序列间距离相似矩阵,发生树。
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-09
文件大小:125952
提供者:
weixin_38502183
女皇:用于微生物组数据分析的快速,可扩展的系统树浏览器-源码
皇后 介绍 Empress是一种快速且可扩展的浏览器,可帮助交互式地探索数据集中要素之间的层次关系。 从历史上看,这些特征通常在社区调查中代表物种的进化关系,并以它们的系统发育或遗传相似性/差异为特征,但实际上,您可以按层级组织查看任何类型的信息。 例如,您可以查看从16S rRNA标记基因测序数据生成的树,或使用 ( )LC-MS数据的代谢树。 Empress支持分类的新功能,例如动画和与排序图的集成,以及已建立的树查看器共有的功能(例如,元数据着色,分支折叠和条形图)。 截屏 “帝国
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-18
文件大小:7340032
提供者:
weixin_42110070
ab12phylo:AB12PHYLO:易于使用的集成应用程序,用于ML系统发育树推断-源码
AB12PHYLO 是一个集成的,易于使用的管道,用于根据ABI测序数据推断最大似然(ML)系统树。 AB12PHYLO的核心是运行并行实例(Kozlov等,2019),并在参考数据库中进行BLAST搜索。 它基于系统发生的位置和序列相似性,实现直观,轻松的样品识别,并借助Tajima D等指标对种群子集进行选择,以评估正在进行的进化。 开发AB12PHYLO来鉴定植物病原体种群,可能是通过与茄属的平衡选择,尤其是在链格孢菌(Alternaria)中。 尽管全基因组测序的兴起,尽管多基因系统
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-15
文件大小:10485760
提供者:
weixin_42143092
ggtree:系统发育树的可视化和注释-源码
ggtree:系统发育树的可视化和注释
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-05
文件大小:365568
提供者:
weixin_42131414
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