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资源分类
搜索资源列表
一种多搜索策略的多生物序列比对自适应遗传算法.pdf
一种多搜索策略的多生物序列比对自适应遗传算法.pdf一种多搜索策略的多生物序列比对自适应遗传算法.pdf
所属分类:
其它
发布日期:2010-02-22
文件大小:288768
提供者:
xgod_cn
生物信息多序列比对clustal
介绍多序列比对工具clustalx *多序列比对的意义 *多序列比对的方法 *自动多序列比对的算法 *Clustalx的使用 *实例分析
所属分类:
其它
发布日期:2010-12-21
文件大小:939008
提供者:
zhang3310028
clusalw 多序列比对工具
多序列比对工具,clustalw多序列比对工具,可以生成多种格式的比对结果以及构建基础的系统发生树
所属分类:
教育
发布日期:2013-03-25
文件大小:325632
提供者:
kongyan1987
隐马尔可夫模型在多序列比对中的应用
序列的多重比对是生物序列分析研究中的一个重要方法。文章首先介绍了HMM 的基本结构,然后着重讨论了HMM 在DNA 序列之间的多重比对中的应用。
所属分类:
专业指导
发布日期:2008-08-28
文件大小:106496
提供者:
hihibin
多序列比对
应用lastz等工具进行多序列比对,可以看看哦
所属分类:
医疗
发布日期:2013-10-14
文件大小:1048576
提供者:
u012441667
多序列比对 clustal X1.81
多序列比对 clustal X1.81,解压即用
所属分类:
教育
发布日期:2014-09-21
文件大小:814080
提供者:
hgxydn
BioXM 2.6 序列比对
生物软件 BioXM 序列比对软件 多基因序列比对
所属分类:
软件测试
发布日期:2014-10-20
文件大小:3145728
提供者:
qq_22227985
多序列比对
主要用于windows系统下的多序列比对。
所属分类:
软件测试
发布日期:2015-03-26
文件大小:4194304
提供者:
qq_26896549
遗传算法模拟生物多序列比对之交叉算子优化
为优化生物多序列比对问题,降低计算难度,提高计算效率,采用遗传算法模拟多序列比对,构造了四种简单的交叉算子及三种后处理方式,分析交叉算子和交叉后处理方式对多序列比对结果的影响。通过实验比较,结果表明多行横向交叉的计算效果最好,后处理方式cross4to2能有效缩短计算时间,二者相结合能很大提高遗传算法的计算效率,从而达到优化多序列比对的目的.
所属分类:
其它
发布日期:2020-04-27
文件大小:1048576
提供者:
weixin_38621565
遗传算法模拟生物多序列比对之初始化的改进
针对应用遗传算法求解生物多序列比对问题的初始化进行了改进.初始种群是遗传算法构造的一个关键部分,本文根据多序列比对的生物特性,在初始种群中的个体中插入连续空位,优化初始种群的个体质量;并在初始种群中加入一定比例的在线比对工具MAFFT优质种子,优化初始种群的整体质量.通过数值模拟实例结果显示,经过这两个优化处理可以生成更高质量的初始种群,得到更好的比对结果,提高多序列比对的计算效率.
所属分类:
其它
发布日期:2020-04-24
文件大小:293888
提供者:
weixin_38672800
clustalx 核酸序列比对程序
这是多重序列比对程序的Windows版本。Clustal X为进行多重序列和轮廓比对和分析结果提供一个整体的环境。 序列将显示屏幕的窗口中。采用多色彩的模式可以在比对中加亮保守区的特征。窗口上面的下拉菜单可让你选择传统多重比对和轮廓比对需要的所有选项。 你可以剪切、粘贴序列以更改比对的顺序;你可以选择序列子集进行比对;你可以选择比对的子排列(Sub-range)进行重新比对并可插入到原始比对中;可执行比对质量分析,低分值片段或异常残基将以高亮显示。
所属分类:
教育
发布日期:2020-08-18
文件大小:4194304
提供者:
Hadoop27
js DNA动态序列比对代码
Javascr ipt动态序列比对代码,随便 写着玩的,在网上见到用VC、VB写的比较多,这个算法以前在高中课本上见到过,我只是用Js写一下试试,或许还不是太准确。
所属分类:
其它
发布日期:2020-10-29
文件大小:29696
提供者:
weixin_38559992
基于多策略人工蜂群的多序列比对算法
多序列比对是生物信息学中最重要和挑战性的任务之一. 针对多序列比对是NP 完全组合优化问题, 引.入Tent 混沌初始化种群策略、不同蜂种的邻域搜索策略和锦标赛选择策略等, 提出了一种基于多策略人工蜂群.的多序列比对算法. 该算法应用Tent混沌初始化种群策略以使初始个体多样化和获取较好初始解; 其次针对不同.蜂种的特性设计不同的邻域搜索策略以平衡算法的全局探索与局部开发能力. 同时引入序列比对的蜜源编码方.法以适应多序列比对的离散性. 实验结果表明, 该算法鲁棒性较强, 能获取较好的比对性能和
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-23
文件大小:373760
提供者:
weixin_38659805
ProteinEvolverABC:通过近似贝叶斯计算估计蛋白质序列比对中的重组和取代率-源码
蛋白质进化者 通过近似贝叶斯计算估计蛋白质序列比对中的重组和取代率 软件包ProteinEvolverABC是一个计算机框架,可通过近似贝叶斯计算来估计蛋白质序列多个比对中的重组和取代率。 该框架基于模拟器ProteinEvolver的特殊版本,该模拟器通过重组(包括各种迁移模型,人口统计学和用户指定的种群/物种树)和蛋白质在不同替代模型下的进化来实现合并。 可以从比对中收集有关进化过程的信息,总共可以计算出16个摘要统计量。 然后,ProteinEvolverABC可以通过拒绝和回归方法在近似
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-14
文件大小:89128960
提供者:
weixin_42107491
TGAA:一个Python程序,用于分析多个序列比对并比较两组物种之间的氨基酸特性-源码
贸易总协定 一个Python程序,用于分析多个序列比对并比较两组物种之间的氨基酸特性
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-13
文件大小:30720
提供者:
weixin_42171132
基于模拟退火和星形比对的共有序列搜索的多序列比对算法
基于模拟退火和星形比对的共有序列搜索的多序列比对算法
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-07
文件大小:401408
提供者:
weixin_38628552
一种新颖的快速且高效存储的并行MLCS算法,用于长序列和大规模序列比对
通常可以将信息抽象为有限字母上的字符序列。 随着大数据时代的到来,来自各个应用领域(例如,生物序列)的序列的长度和大小不断增加,导致了经典的NP难题,即寻找多个序列的多个最长公共子序列(即MLCS问题在生物信息学,计算基因组学,模式识别等领域具有许多应用),成为研究热点并面临严峻挑战。 在本文中,我们首先揭示了基于主导点的MLCS算法很难应用于长序列和大规模序列比对。 为了克服它们的缺点,基于提出的问题解决模型和并行拓扑排序策略,我们提出了一种新颖的高效并行MLCS算法。 对随机序列和生物学序列
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-06
文件大小:655360
提供者:
weixin_38742453
rnalign2d:使用MUSCLE和二级结构数据执行RNA的多序列比对的Python工具-源码
RNAlign2D RNAlign2D是一种Python包装器,它允许使用有关二级结构和序列的信息来比对多个RNA分子。 为此,使用了MUSCLE程序,但可以对其进行调整以使用任何其他多序列比对工具。 该工具首先去除常见的RNA修饰,然后将RNA序列和二级结构转换为假氨基酸序列(请不要误解翻译过程-这只是技术解决方案),然后使用MUSCLE来比对假氨基酸序列。 最后恢复过程,并恢复与原始序列和二级结构的比对。 点括号格式 格式,成对残基标记为方括号(),未成对残基标记为点。 例如,包含发夹的
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-18
文件大小:116736
提供者:
weixin_42165973
museqa:使用混合并行计算的多序列比对器-源码
穆塞卡 Museqa,发音为moo-zee-kah ,是用于混合并行计算环境的多序列比对器。 动机 在生物信息学中,多种生物序列的整体比对至关重要。 这使生物学家能够了解许多不同物种之间的进化关系。 但是,对该问题的最佳解决方案在计算上是困难的,即,如果序列的数量或此类序列的大小任意大,则不能及时执行。 作为替代方案,已经出现了几种方法作为对该问题的启发式方法。 该项目的重点是在其三个单独的步骤中使用混合并行计算探索和实现渐进式比对启发法。 系统发育树生成; 最后是渐进式对齐本身。 该启发
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-10
文件大小:1048576
提供者:
weixin_42128270
lexicon-mono-seq:基于DOM文本的多序列比对库-源码
标题 布局 Lexicon-Mono-Seq,基于DOM文本的异步MSA查看器 发布 词汇单音序列 LexiconMonoSeq是使用等宽字体的多序列比对查看器( )。 您也可以使用此工具显示任意数量的字符串。 该库异步呈现DOM Text。 免责声明 在为LexiconMonoSeq提供可选的参数duration和durationPaint时要小心,因为低值(<300ms)会引起易感人群癫痫发作。 请遵循此处提供的指南: : 依存关系 没有。 工具的目的 实际上,这个小脚本是一个
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-05
文件大小:46137344
提供者:
weixin_42143221
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