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搜索资源列表

  1. Globin-like蛋白质折叠类型识别

  2. 蛋白质折叠类型识别是蛋白质结构研究的重要内容. 以SCOP中的Globin-like折叠为研究对象，选择其中序列同一性小于25%的17个代表性蛋白质为训练集，采用机器和人工结合的办法进行结构比对，产生序列排比，经过训练得到了适合Globin-like折叠的概形隐马尔科夫模型(profileHMM)用于该折叠类型的识别. 以Astral1.65中的68057个结构域样本进行检验，识别敏感度为99.64%，特异性100%. 在折叠类型水平上，与Pfam和SUPERFAMILY单纯使用序列比对构建的

  3. 所属分类：专业指导

    • 发布日期：2009-05-11
    • 文件大小：4194304
    • 提供者：growking

  1. 导出数据库的同源蛋白质结构和结构

  2. 导出数据库的同源蛋白质结构和结构 导出数据库的同源蛋白质结构和结构

  3. 所属分类：专业指导

    • 发布日期：2009-05-26
    • 文件大小：359424
    • 提供者：mali0813

  1. 无序蛋白质结构预测方法研究.caj

  2. 无序蛋白质结构预测方法研究,论文将信号处理方便的知识用在了生物技术上面

  3. 所属分类：Actionscript

    • 发布日期：2015-06-19
    • 文件大小：1048576
    • 提供者：qq_21856055

  1. 蛋白质结构及水解状态对水酶法制备调和油过程中油脂释放的影响

  2. 蛋白质结构及水解状态对水酶法制备调和油过程中油脂释放的影响，李杨，齐宝坤，将大豆、花生、亚麻籽、油茶籽及其混合油料采用挤压膨化水酶法进行提油。通过红外光谱法探究挤压膨化过程中混合油料蛋白质结构变

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-03-05
    • 文件大小：1048576
    • 提供者：weixin_38703626

  1. 应用优化的隐马尔可夫模型预测蛋白质结构类

  2. 应用优化的隐马尔可夫模型预测蛋白质结构类，杨惠云，石鸥燕，针对3-状态隐马尔可夫模型（Hidden Markov Model, HMM）预测蛋白质结构类准确率不高的问题，提出了优化的7-状态和8-状态HMM。以Matlab7.0为平台

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-01-03
    • 文件大小：465920
    • 提供者：weixin_38614462

  1. 基于多特征信息及Ma-Ada多分类器融合的蛋白质结构类预测

  2. 基于多特征信息及Ma-Ada多分类器融合的蛋白质结构类预测

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-19
    • 文件大小：1048576
    • 提供者：weixin_38560768

  1. 利用蛋白质序列结构特征预测蛋白质结构类别的新策略

  2. 利用蛋白质序列结构特征预测蛋白质结构类别的新策略

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-16
    • 文件大小：100352
    • 提供者：weixin_38741531

  1. 使用PseAA结构特性和二级结构模式对蛋白质结构类别进行高精度预测。

  2. 使用PseAA结构特性和二级结构模式对蛋白质结构类别进行高精度预测。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-16
    • 文件大小：579584
    • 提供者：weixin_38686860

  1. 基于PSI-BLAST图谱的蛋白质结构分类预测方法

  2. 基于PSI-BLAST图谱的蛋白质结构分类预测方法

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-03
    • 文件大小：131072
    • 提供者：weixin_38666232

  1. 基于Profile HMM和DMQPSO的蛋白质结构预测。

  2. 基于Profile HMM和DMQPSO的蛋白质结构预测。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-26
    • 文件大小：667648
    • 提供者：weixin_38752907

  1. p2rank：P2Rank：基于机器学习的蛋白质-配体结合位点预测工具。 独立的命令行程序Java库，用于根据蛋白质结构预测配体结合口袋-源码

  2. P2排名 基于机器学习的配体结合位点预测。 描述 P2Rank是一个独立的命令行程序，可以从蛋白质结构预测配体结合口袋。 它无需依赖外部软件来计算复杂特征或依靠已知蛋白质-配体模板的数据库即可获得较高的预测成功率。 要求 Java 8至15 PyMOL 1.7（或更高版本）用于查看可视化效果（可选） P2Rank已在Linux，macOS和Windows上进行了测试。 在Windows上，建议使用bash控制台而不是cmd或PowerShell来执行程序。 设置 P2Rank不需要安装。 二

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-25
    • 文件大小：114294784
    • 提供者：weixin_42165018

  1. 使用域间相互作用网络对蛋白质结构域和复杂疾病之间的关联进行优先排序

  2. 找到人类复杂疾病的基础遗传变异并找到导致这些疾病的基因至关重要。 由于蛋白质通常由几个结构域组成，因此可以合理地假设有害的遗传变异可能会改变蛋白质域的结构，影响蛋白质的功能并最终导致疾病。 基于这种理解，作者探索了恢复蛋白质结构域与复杂疾病之间关联的可能性。 作者根据非同义单核苷酸多态性（nsSNPs）与复杂疾病之间的关联，疾病之间的相似性以及蛋白质与领域之间的关系来定义蛋白质域与疾病家族之间的关联。 基于域域交互网络，作者提出了一种“按罪恶感”原则，根据候选域与域域交互网络中与一组种子域的平均

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-24
    • 文件大小：410624
    • 提供者：weixin_38624437

  1. 用伪氨基酸组成预测蛋白质结构分类：利用细胞自动机图像的几何矩的方法

  2. 用伪氨基酸组成预测蛋白质结构分类：利用细胞自动机图像的几何矩的方法

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-23
    • 文件大小：591872
    • 提供者：weixin_38651165

  1. 基于距离的最大熵预测蛋白质结构域的新方法

  2. 在实验和计算结构生物学中，检测蛋白质结构域的边界都是一项重要且具有挑战性的任务。 在本文中，提出了一种仅从序列信息中检测蛋白质的域结构的有前途的方法。 该方法基于分析从数据库搜索得到的多个序列比对。 定义了多个度量以量化沿序列的每个位置的域信息内容。 然后使用支持向量机将它们组合成单个预测变量。 更重要的是，首先将域检测视为不平衡的数据学习问题。 针对支持向量机（SVM）特征空间中基于距离的最大熵，提出了一种新的欠采样方法。 总体精度约为80％。 仿真结果表明，该方法不仅可以帮助预测蛋白质的完整

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-22
    • 文件大小：327680
    • 提供者：weixin_38618540

  1. DomFun：使用蛋白质结构域和功能注释之间的关联进行蛋白质功能预测-源码

  2. DomFun DomFun是使用系统方法将功能分配给未知蛋白质的新系统，而无需考虑其序列但其功能域与功能系统相关联。 它使用在蛋白质结构域和功能注释之间计算的关联作为训练数据集，并通过查找蛋白质的结构域以及它们是否已与功能注释（在GO分子功能，生物学过程，KEGG和Reactome途径术语中）相关联，对蛋白质进行预测（使用UniProt标识符）。 ）。 安装 将此行添加到您的应用程序的Gemfile中： gem 'DomFun' 然后执行： $ bundle 或自己安装为： $ gem

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-09
    • 文件大小：32768
    • 提供者：weixin_42116604

  1. alphafold_pipeline：从seq到pdb的端到端蛋白质结构预测管线-源码

  2. Alphafold管道 端到端的蛋白质结构预测流程，从seq到pdb。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-08
    • 文件大小：39936
    • 提供者：weixin_42114041

  1. proteinnet：用于蛋白质结构机器学习的标准化数据集-源码

  2. 蛋白质网 ProteinNet是用于机器学习蛋白质结构的标准化数据集。 它提供蛋白质序列，结构（和），多个序列比对（ ），位置特定的评分矩阵（ ），以及标准化的拆分。 ProteinNet建立在两年期评估的基础上，该评估对最近解决但尚未公开获得的蛋白质结构进行盲目预测，以提供推动计算方法学前沿的测试集。 它被组织为一系列数据集，涵盖了CASP 7至12（涵盖十年），以提供一系列数据集大小，从而可以在相对数据贫乏和数据丰富的体制中评估新方法。 请注意，这是一个初步版本。 用于构建数据集的原始

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-04
    • 文件大小：74752
    • 提供者：weixin_42131424

  1. mmtf-蛋白质组学：在3D蛋白质结构上映射蛋白质组学数据的方法-源码

  2. mmtf-蛋白质组学：在3D蛋白质结构上映射蛋白质组学数据的方法

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-04
    • 文件大小：2097152
    • 提供者：weixin_42127020

  1. icn3d：基于WebGL的蛋白质结构查看器-源码

  2. iCn3D结构查看器 ， 关于iCn3D “我在3D中看到”（iCn3D）Structure Viewer是一个使用Three.js和jQuery的基于WebGL的3D查看器。 iCn3D可以同步3D结构，2D交互以及1D序列和注释的显示。 用户的自定义显示可以保存为短URL或PNG图像。 可以从下载完整的iCn3D软件包，包括Three.js和jQuery。 此页面中的“下载ZIP”链接不包含第三方库。 在iCn3D中查看3D结构：打开链接 ，输入一个PDB ID，然后单击“加载”。 您也

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-04
    • 文件大小：560128
    • 提供者：weixin_42097208

  1. ProteinEnsembles.jl：使用ExProSE算法生成和扰动蛋白质结构整体-源码

  2. ProteinEnsembles.jl：使用ExProSE算法生成和扰动蛋白质结构整体

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-03
    • 文件大小：719872
    • 提供者：weixin_42170064
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