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  1. 通过读入文件将DNA序列对齐

  2. 用c语言实现贪心算法，将读入的DNA序列对齐，并将其输出

  3. 所属分类：C/C++

    • 发布日期：2013-06-11
    • 文件大小：436224
    • 提供者：u010705622

  1. 基因序列对比

  2. 类基因由4种核苷酸 分别用字母ACTG表示 要求编写一个程序 按以下规划比较两个基因序列并确定它们的相似程度 即两 给出两个基因序列AGTGATG和GTTAG 它们有多相似呢 测量两个基因的相似度一种方法称为对齐 使用对齐方法可以在基因的适当位置加入空格 让两个基因的长度相等 然后根据基因的分值矩阵计算分数 A C G T A 5 1 2 1 3 C 1 5 3 2 4 G 2 3 5 2 2 T 1 2 2 5 1 3 4 2 1 比较AGTGATG与GTTAG 第一种对齐方案为： 首先可以

  3. 所属分类：Java

    • 发布日期：2014-01-11
    • 文件大小：9216
    • 提供者：daijanfeng

  1. 生物分析软件MEGA5.05

  2. 生物分析软件MEGA5.05主要用于DNA、氨基酸序列的对齐比对和进化树的构建

  3. 所属分类：医疗

    • 发布日期：2014-07-07
    • 文件大小：5242880
    • 提供者：baidu_17334337

  1. DNA序列对齐

  2. 算法导论：15-3编辑距离（b)，DNA序列对齐算法

  3. 所属分类：C++

    • 发布日期：2014-10-25
    • 文件大小：2048
    • 提供者：kkewwei

  1. 汪浩--专业写作DNA序列对齐实验项目--杨宁老师

  2. 动态规划算法实现：花费时间以及动态规划结果，得到相应的对齐序列。 分治算法：由算法得到花费时间

  3. 所属分类：Java

    • 发布日期：2018-06-28
    • 文件大小：4096
    • 提供者：whandwho

  1. 药用动物乌梢蛇线粒体基因组全序列分析

  2. 药用动物乌梢蛇线粒体基因组全序列分析，齐迎菊，刘杰，摘要：【目的】 获取药用动物乌梢蛇线粒体基因组全序列。 【方法】采用Ion Torrent PGM技术，对乌梢蛇全基因组DNA进行提取测序，采用MIRA

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-02-15
    • 文件大小：559104
    • 提供者：weixin_38701407

  1. X染色体回文序列对称性分析

  2. X染色体回文序列对称性分析，齐燕姣，侯风萍，DNA回文序列对称性的研究对于了解其结构和功能具有至关重要的意义。首先，本文通过利用DNA序列比对的方法，分析了人类、黑猩猩、红

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-02-06
    • 文件大小：367616
    • 提供者：weixin_38530995

  1. Computational-Genomics:计算基因组学的Java智能项目，其中包含-源码

  2. 计算基因组学软件 计算基因组学Java项目，其中包括：成对序列比对，系统发生和多序列比对。 成对序列比对 计算两个序列（DNA，RNA或蛋白质）的成对序列比对的程序。 •输入（用于输入参数的简单GUI）： 两个序列的文本字段（允许的字符az和AZ） 带有替换矩阵值的字段。例如：匹配2不匹配-1 indel -1.5间隙0•单选按钮以选择对齐算法：o整体对齐o末端空间自由对齐o局部对齐o仿射间隙罚分模型对齐•按钮以启动算法。 •输出（带有对齐输出的GUI窗口）o成对对齐，显示所有匹配项，子项和

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-19
    • 文件大小：11264
    • 提供者：weixin_42127369

  1. nim-dna-seq:Nim软件包，用于处理核苷酸序列数据-源码

  2. bio_seq 一个用于将核苷酸编码为IUPAC模糊度代码以及写入和读取FASTA文件的库。 基于的核苷酸的8位无符号整数表示形式 对齐解析 对于解析对齐，要求所有FASTA条目都具有相同的长度，否则将引发错误。 解析对齐字符串 import bio_seq let s = ">header1 \n ACTG \n >header2 \n >CTUG" let r = parseFastaAlignmentString (s) 解析对齐文件 import nim_seq l

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-07
    • 文件大小：9216
    • 提供者：weixin_42128988

  1. SeqDoC_1.2：所有SeqDoC代码的存储库-html和脚本-源码

  2. SeqDoC_1.2 所有SeqDoC代码的存储库-html和脚本 SeqDoC（色谱图的序列差异）对齐并执行两个ABI DNA序列色谱图的减法比较。 处理减去的配置文件以突出显示单个基本更改的差异特征。 有关使用和实施的完整详细信息，请访问 。 SeqDoC当前可从公开使用。 新增功能-SeqDoC现在可作为Docker容器在。 要从头开始设置自己的SeqDoC服务器，请按照以下说明进行操作。 也可以使用VirtualBox作为本地VM运行（请参阅最后的其他步骤，以允许从主机Web浏览

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-15
    • 文件大小：145408
    • 提供者：weixin_42148053

  1. delta：Delta是在Go中实现的命令行差异工具-源码

  2. 三角洲 Delta既是Go库又是用于文本差异的命令行实用程序。 差异可以在浏览器中显示，也可以使用--cli标志在命令行中--cli 。 安装 brew install octavore/tools/delta 描述 Delta实现了两个差异函数：Smith-Waterman和直方图差异。 是一种动态编程算法，用于对齐两个序列，在这种情况下为文本序列。 它起源于生物信息学，用于比对DNA序列。 是一种diff算法，它首先在JGit实现，然后移植到git ，在这里可以与git diff --h

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-05
    • 文件大小：153600
    • 提供者：weixin_42136826