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搜索资源列表

  1. edgeR说明文档

  2. 进行差异表达基因筛选，包含芯片数据和RNAseq的数据，可以是多样本也可以是单样本

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2012-03-11
    • 文件大小：300032
    • 提供者：aipeng520

  1. RNA-seq Data Analysis a practical approach.zip

  2. RNA-seq数据分析实用方法, 介绍了RNA-seq分析的很多方法，比如edgeR，limma包等。

  3. 所属分类：讲义

    • 发布日期：2020-03-28
    • 文件大小：10485760
    • 提供者：goghaaie

  1. diffanalyseR:与R中的NGS计数数据分析相关的功能-源码

  2. 扩散分析 用于自动化与R中的NGS计数数据分析相关的常见任务的功能。 安装 # / Check for BiocManager: if ( ! requireNamespace( " BiocManager " , quietly = TRUE )){ install.packages( " BiocManager " ) BiocManager :: install() } # / Bioc packages: pk <- c( " BiocParallel " , " edge

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-16
    • 文件大小：32768
    • 提供者：weixin_42099151

  1. edger:创建用于测量恒星流出腔的半张角的算法-源码

  2. 边缘 创建用于测量恒星流出腔的半张角的算法。 在我们完成论文发表之前，请不要在学术论文中使用（Fedriani，Duncan 2021，准备中）。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-09
    • 文件大小：691200
    • 提供者：weixin_42102358

  1. EDGER:创建用于测量恒星流出腔的半张角的算法-源码

  2. 边缘 创建用于测量恒星流出腔的半张角的算法。 在我们完成论文发表之前，请不要在学术论文中使用（Fedriani，Duncan 2021，准备中）。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-09
    • 文件大小：688128
    • 提供者：weixin_42135754

  1. 定量-ChIPseq-车间：EuroBioc 2020研讨会：使用DiffBind进行ChIP和ATAC分析-源码

  2. 标题 作者 日期 输出 定量ChIPseq车间 罗里·斯塔克 2020年11月25日 html_document ChiP-seq，ATAC-seq和相关DNA富集测定的定量分析。 讲师 罗里·史塔克（Rory Stark），英国剑桥大学癌症研究中心计算机生物学首席科学家 车间介绍 该研讨会将演示在Bioconductor中对ChIP-seq数据进行定量分析（特别是差异结合分析）所涉及的步骤，并讨论一些相关检测方法，例如ATAC-seq。 将特别注意对齐读取的处理，包括黑名单，灰名单，质量和重复

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-21
    • 文件大小：410624
    • 提供者：weixin_42116596

  1. RNA-seq-workshop：RNA-seq-workshop-源码

  2. RNA序列工作室 这次RNA-seq研讨会旨在让您开始自己的RNA-seq分析，并假设您已经熟悉bash和R的基础知识。 我们将使用NeSI HPC进行某些分析，因此请确保您拥有NeSI帐户并且能够登录。 浏览讲习班的准备文件，以确保您准备： 研讨会大纲（上午9点至下午4点） RNA序列概述 如何QC一个fastq？ 如何修剪序列文件？ 修整质量 适配器修整 如何使用HISAT2在参考上比对测序读数 创建参考序列 对齐参考上的读数 定义对齐格式 SAMtools简介 如何获得计数矩阵

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-15
    • 文件大小：2097152
    • 提供者：weixin_42161497

  1. smallRNA-polymRNA:小RNA和多核糖体测序数据的处理和分析-源码

  2. smallRNA-多核糖体序列 用于处理和分析小RNA和多核糖体测序数据的脚本。 使用WBcel235进行注释。 依存关系 fastQC（v0.11.9） cutadapt（v2.10） 领结2（v2.3.4.3） samtools（v1.11） miRDeep2（v2.0.1.2） FeatureCounts（Subread，v2.0.0） edgeR（v3.11） 生物基质（v2.46.0） HISAT2（v2.10） 管道 小RNA序列 秀丽隐杆线虫基因组注释： C.ele

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-29
    • 文件大小：8388608
    • 提供者：weixin_42117037