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资源分类
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树结构显示软件Treeview
用于显示进化树的软件,它可以读取NEXUS及PHYLIP生成的进化树格式文件,生成进化树,并输出到打印机。
所属分类:
专业指导
发布日期:2009-10-06
文件大小:959488
提供者:
junjie017
phylip进化分析工具
PHYLIP软件是一个免费的集成的进化分析工具,有华盛顿大学遗传学系Joseph felsenstein 编写,1980年首次释放,目前已经升级到3.6.7版本。PHYLIP包含了35个程序,这些程序基本上囊括了系统发生分析方面的所有方面,并且可以在很多平台上运行。包括分子程序组、距离程序组、基因频率组、连续字符组、不连续字符组和进化树绘制组。
所属分类:
专业指导
发布日期:2009-12-16
文件大小:1048576
提供者:
bbc1172000
Philip Mifare One IC卡读卡写卡程序
可以进行phylip Mifare One 类型的IC卡的任意Sector的数据区的读写。
所属分类:
专业指导
发布日期:2010-03-13
文件大小:17408
提供者:
maple625
常用生物数据分析软件
第 1 章 Unix/Linux操作系统介绍...........................................................................................................1 1.1 远程登陆..............................................................................................................
所属分类:
嵌入式
发布日期:2010-08-04
文件大小:6291456
提供者:
shambalas
philip 3.68
PHYLIP是由Joseph Felsenstein开发的多平台操作系统常用系统发生推论软件(Phylogeny Inference Package),具有DNA和蛋白序列分析、限制性酶切位点分析、距离矩阵和基因频率、进化树绘制,可以通过许多选项精确控制分析过程。
所属分类:
专业指导
发布日期:2010-12-10
文件大小:3145728
提供者:
sand0811
进化树构建-phylip-3.695
PHYLIP是一个综合的系统发生分析软件包,由华盛顿大学的JosephFelsenstein开发的。现在该软件包可完成许多系统发生分析。软件包中可用的方法包括了简约法、距离矩阵
所属分类:
PHP
发布日期:2015-03-19
文件大小:11534336
提供者:
qq_26694291
系统进化树构建
系统进化树的构建,下面介绍几个软件的使用。首先是PHYLIP。其是多个软件的压缩包,下载后双击则自动解压。当你解压后就挥发现PHYLIP的功能极其强大,主要包括五个方面的功能软件:i,DNA和蛋白质序列数据的分析软件。ii,序列数据转变成距离数据后,对距离数据分析的软件。 iii,对基因频率和连续的元素分析的软件。iv,把序列的每个碱基/氨基酸独立看待(碱基/氨基酸只有0和1的状态)时,对序列进行分析的软件。v,按照DOLLO简约性算法对序列进行分析的软件。vi,绘制和修改进化树的软件。在此,
所属分类:
讲义
发布日期:2015-08-07
文件大小:232448
提供者:
qq_30424073
几个进化树相关软件的使用方法
我在此介绍几个进化树分析及其相关软件的使用和应用范围。这几个软件分别是PHYLIP、PUZZLE、PAUP、TREEVIEW、CLUSTALX和PHYLO-WIN(LINUX)。
所属分类:
专业指导
发布日期:2017-09-08
文件大小:225280
提供者:
yyq8294
系统发生分析软件及应用详解
此文件包含clustalx,phylip,treeview及应用详解,适合系统发生树构建
所属分类:
专业指导
发布日期:2009-04-10
文件大小:6291456
提供者:
qizhi502
phylip工具
构建进化树可以用DNA序列,也可以用protein序列。一、利用phylip进行蛋白序列进化树分析步骤 1. 运行Clustalw,得到protein.phy文件; 2. 运行seqboot,输入protein.phy文件,输出protein_1.outfile。R选择1000,seed number: 3,然后选择Y。将得到的protein_1.outfile改名为protein_2.infile。 3. 运行protpars,输入protein_2.infile,输出protein_2.o
所属分类:
其它
发布日期:2018-08-15
文件大小:3145728
提供者:
vic_hall
matlab开发-phylipdnaparsimonydnaparsgui
matlab开发-phylipdnaparsimonydnaparsgui。phylip 3.6中的DNA简约算法的图形用户界面。
所属分类:
其它
发布日期:2019-08-28
文件大小:313344
提供者:
weixin_38743481
dataset-creator:接收SeqRecordExpanded对象并创建系统发育软件的数据集-源码
系统发育软件的数据集创建者 测试 包裹 Dataset-Creator-创建多种格式的系统发育数据集的简便方法 文档: 接收SeqRecordExpanded对象并创建系统发育软件的数据集,例如MrBayes,TNT,BEAST,RAxML,MEGA等。 特征 以以下格式创建数据集:FASTA,GenBankFASTA,NEXUS,TNT,MEGA和Phylip。 可以生成DNA和氨基酸序列的数据集。 可以生成简并序列的数据集。 它可以按密码子位置或基因对数据集进行分区。 快速开始 第一的:
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-21
文件大小:168960
提供者:
weixin_42117485
genozip:用于基因组文件(FASTQ,SAMBAM,VCF,FASTA,GVF,23andMe ...)的压缩器,比gzip压缩多达5倍,并且速度也更快-源码
Genozip (可在Conda , Docker Hub和) Genozip是一种用于基因组文件的压缩器-虽然它可以压缩任何文件(即不仅是基因组文件),但它经过优化可以压缩FASTQ,SAM / BAM / CRAM,VCF / BCF,FASTA,GVF,Phylip和23andMe文件。 如果它们已经使用.gz .bz2 .xz进行压缩,它甚至可以对其进行压缩(有关受支持的文件类型的完整列表,请参见'genozip --help = input')。 压缩率取决于要压缩的数据,通常,压缩
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-15
文件大小:3145728
提供者:
weixin_42150341
ddrad_scripts:用于处理ddRAD数据的随机脚本,包括pyRAD的输出-源码
ddrad_scr ipts 用于处理ddRAD数据的随机脚本,包括pyRAD的输出 snps2phylip.py-将.snps文件从pyRAD转换为Phylip格式 用法: snps2phylip -f [input.snps] -o [output.phy; optional, default="out.phy"] getbadpyrad.py-将缺少数据的样本从pyRAD .stats文件写入CSV,以便可以将其输入到pyRAD params文件中 用法: getbadpyrad.py
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-10
文件大小:9216
提供者:
weixin_42120541