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  1. scRepertoire:单细胞免疫分析的工具包-源码

  2. 曲目 单细胞免疫分析的工具包 介绍 单细胞测序是免疫学和肿瘤学领域的一项新兴技术，它使研究人员能够将RNA定量和其他方式耦合在一起，例如在单个细胞水平上对免疫细胞受体进行谱分析。 已经创建了许多工作流程和软件包来处理和分析单细胞转录组数据。 这些程序包使用户可以利用在基于单细胞的实验中生成的数据的广阔维度，并将数据提炼成新颖的见解。 与转录组领域不同，缺少允许单细胞免疫受体分析的软件选项。 为了使用户能够轻松地将RNA和免疫分布图结合起来，scRepertoire能够处理从10倍基因组学Chro

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-26
    • 文件大小：3145728
    • 提供者：weixin_42133680

  1. dkm:动态内核匹配（DKM），用于对具有不合格特征的数据进行分类-源码

  2. 对不符合行和列的数据进行建模：以T细胞受体数据集为例 出版物已提交以供同行评审 西南大学人口与数据科学系助理教授JARED L OSTMEYER 介绍 统计分类器是数学模型，使用示例数据在预测标签的特征中查找模式。大多数统计分类器都假定要素像电子表格一样按行和列排列，但是许多类型的数据不符合此结构。序列是另一类数据的示例，这就是为什么此数据通常存储在文本文档中而不是电子表格中的原因。为了建立序列和其他不符合特征的统计分类器，我们开发了所谓的动态内核匹配（DKM）。 DKM类似于卷积网络中的最大

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-22
    • 文件大小：5242880
    • 提供者：weixin_42138525

  1. pisnrs-源码

  2. PisNRs PisNRs是用于预测核受体的潜在抑制剂和支架的Python模块，该模块在RDKit（基于MIT许可的scikit-learn）的基础上构建。 安装 当前，PisNR需要以下依赖项： Python（> = 3.6） rdkit（> = 2018.03.2.0） scikit学习（> = 0.19.1） 熊猫（> = 0.23.1） 建议使用Ancaconda进行程序包管理和环境配置。 1. Anaconda简介 用户可以在下载并安装Anaconda

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-20
    • 文件大小：69206016
    • 提供者：weixin_42166105

  1. BM.Atlas-源码

  2. 脑图集 大脑的3D交互式地图，显示了针对各种分割模型的用户区域和功能以及颜色映射可视化效果（细胞学，受体，通路，Braak）。 请在此处查看完整的引文列表： :

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-19
    • 文件大小：459276288
    • 提供者：weixin_42110070

  1. arekkas_HteFramework_XXXX_2021:观察性保健数据库网络中基于风险评估治疗效果异质性的框架-源码

  2. 抽象的 目的：观察健康数据科学和信息学（OHDSI）计划的目标之一是在大型观察数据库中进行人群水平的治疗效果评估。众所周知，由于治疗效果因基线风险不同的患者而异，因此我们旨在通过基于风险的治疗效果异质性评估框架来扩展OHDSI方法库。 材料和方法：提议的框架包括五个步骤：1）问题的定义，即人群，治疗，比较者和感兴趣的结果； 2）识别相关数据库； 3）开发感兴趣结果的预测模型； 4）估计预期风险分层中的倾向得分，并估计预期风险分层中的相对和绝对治疗效果； 5）评估和结果展示。 结果：我们通过评估血

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-19
    • 文件大小：819200
    • 提供者：weixin_42104778

  1. Benchmarking_splice_prediction_tools:基于深度学习的剪接预测工具的基准测试分析脚本，用于使用功能性剪接方法对未知重要性的变体进行分类-源码

  2. 基准熔接预测工具 该存储库包含用于分析手稿“使用功能性拼接分析对深度学习拼接预测工具进行基准测试”的脚本。 用于分析的所有变体和剪接预测分数都包含在variant_scores.xlsx 。数据集是： ABCA4 NCSS（非规范剪接位点）变体 ABCA4 DI（深度内含子）变体 MYBPC3 NCSS变体 分析脚本 analysis_variants.py 此脚本提供有关数据集中的变体的信息： 变体数量： 非剪接改变变体的数量 剪接变体的数量 位于剪接供体位点（SDS）附近的变体数量 SDS

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-18
    • 文件大小：5242880
    • 提供者：weixin_42109598

  1. gtn:加权有限状态传感器的自动微分-源码

  2. GTN：使用WFST的自动区分 | 什么是GTN？ GTN是使用加权有限状态传感器进行自动微分的框架。 该框架是用C ++编写的，并具有与Python的绑定。 GTN的目标是使学习算法中结构的添加和实验变得更加简单。 此结构被编码为加权自动机，可以是受体（WFSA）或传感器（WFST）。 使用gtn您可以根据对简单图形的操作来动态构建复杂图形。 只需调用gtn.backward自动微分就可以针对任何输入图或中间图给出梯度。 还检出存储库 ，该存储库由GTN应用程序组成，包括手写识别（HWR

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-17
    • 文件大小：438272
    • 提供者：weixin_42122988

  1. ora-srf:ora（https的奇异性配方文件-源码

  2. Bio :: ORA的奇异配方文件，这是一个轻量级的对象，用于识别哺乳动物的嗅觉受体基因。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-16
    • 文件大小：2048
    • 提供者：weixin_42109639

  1. apiBloodDonors-源码

  2. PROYECTO最终MÓDULO后端BEDU-SANTANDER ¿Cómofunciona nuestra API？ 墨西哥国家石油公司（CRUD），西班牙石油公司（CRUD），西班牙石油公司，西班牙石油公司，西班牙石油公司，西班牙石油公司，西班牙石油公司要求。 Entonces，新API和其他部分： 多纳多雷斯。 受体。 可能需要注册的人可以接受接受。 赫鲁库 El Blood捐赠者链接到siguiente： ¿PorQuéMONGODB？ Elegimos效用MONGODB的基础

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-15
    • 文件大小：27648
    • 提供者：weixin_42125867

  1. To-CG-File:包含To-CG-File脚本和相关依赖项的存储库-源码

  2. 到CG文件 包含To-CG-File脚本（带有关联的依赖项）的存储库。 “冠状病毒穗蛋白和ACE2受体的粗粒化建模”文件夹包含与同名物理学前沿文章（当前正在提交审查中）相关的此软件的版本。 具有相关变更日志的更新生产模型将不时在此处发布。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-13
    • 文件大小：12288
    • 提供者：weixin_42140710

  1. hogtie-源码

  2. HoGTIE（水平基因转移识别引擎） 最初被认为仅广泛存在于原核生物中，最近的研究表明整个生命树中普遍存在水平基因转移（HGT）。 HoGTIE结合了基于k-mer的系统发育比较和系统发育比较，以鉴定受体物种中含有HGT的基因组区域和序列。 开发中 HoGTIE正在积极开发中。 如果您想签出代码或对代码有所贡献，可以通过以下方式在本地安装hogtie： # coming soon... # conda install hogtie -c conda-forge -c bioconda # f

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-07
    • 文件大小：23552
    • 提供者：weixin_42134338

  1. NFA-to-Regex-源码

  2. NFA到REGEX 将不确定的有限接受器转换为正则表达式。 介绍 非确定性有限接受器（NFA）是一种有限状态机，它读取字符串作为输入，并且可以接受或拒绝它。 与确定性有限接受器不同，NFA是不确定性的，这意味着在给定输入的情况下，机器有时可以选择其下一个状态。 下图给出了一个有限状态机的例子。 图1：不确定的有限受体示例 在上面的示例中，λ是一个空字符串，q_0是初始状态，也是最终状态。 边沿读数为1表示当输入中的下一个字符为1时机器将沿该边沿向下移动，而边沿标签“ 1,0”表示机器可沿1或

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-06
    • 文件大小：97280
    • 提供者：weixin_42173218

  1. immunotation:R框架用于在人群中一致注释超多态HLA基因-源码

  2. 用户指南： immunotation包装 MHC分子 MHC（主要组织相容性复合物）分子是向T细胞呈递抗原的多种细胞表面复合物家族。 MHC分子分为三类（I类MHC，II类MHC和非经典MHC），它们的蛋白质亚基组成和可与之相互作用的受体类型不同。 例如，MHC I类分子由一条多态性的α链和一条不变的β链（_β_2-微球蛋白）组成，并将肽抗原呈递给表达MHC-1特异性共受体CD8的T细胞。 MHC II类分子通常由多态性的一条α-和一条β-链组成。 MHC II类分子将肽抗原呈递给表达MHC-I

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-06
    • 文件大小：1048576
    • 提供者：weixin_42169245

  1. morphct-源码

  2. 知识产权 MorphCT已根据GPL3许可证发布（请参阅LICENSE）。 如果您在已发表的作品中使用我们的代码，请阅读并引用我们的《和我们的 。 代码说明 该代码的目的是形成一个模块化的计算管道，该管道可以将Angstroem长度尺度上的有机分子形态强有力且一致地与数百纳米的电子设备性能相关联。 MorphCT通过以下方式实现此目的： 将任何粗粒度的有机形态转换为原子表示，然后通过称为细粒度的过程提交给量子化学计算。 将形态分解为带电活性的生色团，带电的载流子（在施主材料的情况下为空穴，

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-06
    • 文件大小：1031168
    • 提供者：weixin_42127369

  1. Zhiping01.github.io-源码

  2. 罗志平 电子邮件： 电话：+85 15910995386 地址：中国北京市建外大街建国路112号100022 教育 工作经验 临床项目 开发用于多发性骨髓瘤的抗CD38单克隆抗体治疗剂的3期临床研究 评估抗CD38单克隆抗体治疗剂对新诊断的多发性骨髓瘤患者的疗效的3期临床研究 绝经前和绝经后患有雌激素受体阳性，HER2阴性的局部晚期或转移性乳腺癌且先前曾接受激素治疗的患者的2期试验 1/2期初步疗效和药代动力学研究评估抗CD38和抗PD-1单克隆抗体在晚期恶性肿瘤患者中的组合 评估免疫抑制剂在

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-04
    • 文件大小：2048
    • 提供者：weixin_42131861

  1. 前沿遗传学2020-源码

  2. 河水牛基因损益分析及阳性选择 该存储库包含自定义脚本，以分析CAFE基因的得失结果。 这些脚本已在论文“水牛在蛋白质降解，嗅觉受体，排毒和免疫系统中的适应性特征”中使用。 它还包含MHC基因坐标。 CAFE分析 运行包含OrthoFinder的synteny管道之后，完成CAFE，然后执行以下操作： 在CAFE中测试不同的模型，然后选择最佳模型。 导入CAFE结果以执行GO，KEGG和Reactome富集分析。 查找所有分支和水牛分支的具有统计上显着的基因损益的基因家族。 MHC坐标分析

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-25
    • 文件大小：98566144
    • 提供者：weixin_42146230

  1. 受体-kobase-源码

  2. 受体-kobase

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-23
    • 文件大小：161792
    • 提供者：weixin_42153793

  1. AutoDock-GPU：适用于GPU和其他加速器的AutoDock-源码

  2. AutoDock-GPU：适用于GPU和其他加速器的AutoDock 关于 OpenCL和Cuda加速版的AutoDock4.2.6。 它通过在多个计算单元上并行处理配体-受体姿势来利用其令人尴尬的可并行LGA。 OpenCL版本是与TU-Darmstadt合作开发的，能够针对CPU，GPU和FPGA架构。 Cuda版本是与Nvidia合作开发的，以便在Oak Ridge国家实验室（ORNL）峰会上运行AutoDock-GPU，其中包括Jubilee Development公司的Aaron

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-21
    • 文件大小：18874368
    • 提供者：weixin_42131628

  1. 预测分子活性：使用QSAR机器学习模型预测有机分子与特定受体的分子结合活性-源码

  2. 预测分子活性 使用QSAR机器学习模型预测有机分子与特定受体的分子结合活性。 诸如此类的虚拟筛选技术通过减少经过高通量筛选的潜在药物的数量来降低药物发现的成本。 该项目表明，机器学习模型可以从药物的分子定量结构-活性关系（QSAR）数据有效预测候选药物。 该代码在ipynb文件中提供，该文件需要一段时间才能运行。 还提供了以科学论文格式对该项目的深入描述。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-21
    • 文件大小：1048576
    • 提供者：weixin_42144366

  1. 受体演示-源码

  2. 建筑受体演示环境 每个节点上的git clone receptor-demo $ git clone https://github.com/saito-hideki/receptor-demo.git 将您的接收者节点列表指定为RECEPTOR_NODES RECEPTOR_NODES="rp00 rp01 rp02 rp03 rp04 rp05 rp06" 在第一个节点（即rp00）的certs /目录下生成ca和cert文件 $ ./bootstrap.sh 将cert / *文件传输到

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-08
    • 文件大小：5120
    • 提供者：weixin_42132354
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