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输入DNA序列输出氨基酸序列 c语言源码
输入一条字符串(由A、T、G、C构成)表式DNA的一条链,输出 1.DNA中与之对应的另外一条链 2.对应mRNA的结构(字符串表示) 3.由mRNA控制合成的蛋白质的氨基酸序列 的c语言源码
所属分类:
C/C++
发布日期:2011-08-15
文件大小:3072
提供者:
gnemoug
Data-Analysis:该存储库包含gen_analysis软件包,该软件包用于基本统计信息和生物数据处理-源码
数据分析 该存储库包含用于基本统计信息的程序包和用于生物数据的处理工具。 此外,不久将添加更多的蛋白质组和转录组分析功能。 这些将包括通过外源条形码对单细胞数据进行双重鉴定,通过变异系数和均值表达进行差分单细胞分析等。 要安装软件包,请转到gen_analysis文件夹,然后pip install -e . 。 依存关系 numpy的= = 1.19.0 熊猫== 1.0.1 matplotlib == 3.1.3 海上== 0.10.0 upsetplot == 0.4.0 more
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-26
文件大小:1048576
提供者:
weixin_42119358
2021_Bottino_Biserial:2020年Bottino和Martínez的数据和范例-源码
2020_Bottino_Biserial_scr ipts 这些是脚本和示例数据文件,以及G. Bottino和L.Martínez撰写的文章《针对蛋白质建模中的约束选择的结构判别分析(XXX)》一文。 配置 为了遵循本教程,您将需要设置一些软件: 如果只想使用分析和选择脚本... M3G的最新版本的Lovoalign和G-Score软件。 您将需要一个FORTRAN编译器来构建那些程序。 我们建议Linux用户使用gfortran 。 如果您emply一个基于Ubuntu的发行,你可以
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-26
文件大小:22020096
提供者:
weixin_42103587
ZoneCalculator-源码
ZoneCalculator 目的 区域计算器有三个主要用途: ①根据用户想要的区域块的数量,计算用户制作的食谱中每种食物所需的成分,卡路里,碳水化合物,脂肪,蛋白质,钠和糖的量 ②计算配方带给使用者的每种营养素的总价值 ③打印出用户输入的食谱的饮食限制事实 手动的 输入 操作说明 输入是一个包含3列的表格,其中包括: 食品名称:食品的第一个字符大写(必须与成分数据文件中的食品名称完全相同) 区域块数:可以是自然数或浮点数。如果是浮动的,请使用.而不是, 。 单位: 行数基于用户的配方 样本输
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-19
文件大小:6144
提供者:
weixin_42122432
Computational-Genomics:计算基因组学的Java智能项目,其中包含-源码
计算基因组学软件 计算基因组学Java项目,其中包括:成对序列比对,系统发生和多序列比对。 成对序列比对 计算两个序列(DNA,RNA或蛋白质)的成对序列比对的程序。 •输入(用于输入参数的简单GUI): 两个序列的文本字段(允许的字符az和AZ) 带有替换矩阵值的字段。例如:匹配2不匹配-1 indel -1.5间隙0•单选按钮以选择对齐算法:o整体对齐o末端空间自由对齐o局部对齐o仿射间隙罚分模型对齐•按钮以启动算法。 •输出(带有对齐输出的GUI窗口)o成对对齐,显示所有匹配项,子项和
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-19
文件大小:11264
提供者:
weixin_42127369
foodcounter:Foodcounter是您日常进餐中的卡路里,蛋白质,碳水化合物和脂肪。 简单明了-源码
食品柜台 Foodcounter是您日常进餐中的卡路里,蛋白质,碳水化合物和脂肪。 简单明了:) Foodcounter允许您注册所有日常餐点并进行可视化显示,更新并免费删除它们。 您还可以查看过去的用餐历史:) 建于 Ruby Ruby on Rails SQLite3 布尔玛框架 入门 正在施工:construction: 先决条件 Ruby 邦德勒 Ruby on Rails Node.js 纱线(v> = 1.2 && <2) 设置 正在施工:constru
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-15
文件大小:688128
提供者:
weixin_42123191
ddgun-源码
DDGun 介绍 DDGun是预测突变后稳定性变化的未经训练的方法 执照 版权所有(C)2019 Ludovica Montanucci,Emidio Capriotti和Piero Fariselli 该程序和此软件包中的所有程序均为免费软件; 您可以根据自由软件基金会发布的GNU通用公共许可证的条款重新分发和/或修改它; 许可的版本2,或(由您选择)任何更高的版本。 分发该程序是希望它会有用,但是没有任何保证; 甚至没有对适销性或特定用途适用性的暗示保证。 有关更多详细信息,请参见GN
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-14
文件大小:4194304
提供者:
weixin_42120405
proyecto_FSE-源码
proyecto_FSE Kong蒂尼多 蛋白质模拟8.11 Windows上的Interfaz grafica形成了USANDO Visual Studio 2017 C# 固件PIC18f4550,lenguaje C usnado XC8 同类固件 xc8 --CHIP=18f4550 firmware.c 描述一般 Control de 2 ventiladores独立于PWM por硬件 Control de tiras led RGB WS2812,2 tiras indepen
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-13
文件大小:354304
提供者:
weixin_42121412
Protein-Lifetime-Project:此python脚本允许用户遵循N端规则获得细胞中蛋白质的寿命,通过该规则,蛋白质半衰期由蛋白质序列中的最后一个氨基酸计算得出-源码
蛋白质终身计划 该python脚本允许用户遵循N端规则获得细胞中蛋白质的寿命,通过该规则,蛋白质半衰期是由蛋白质序列中的最后一个氨基酸计算出来的。 背景 90年代,亚历山大·瓦尔沙夫斯基(Alexander Varshavsky)和他的团队首先描述了N端规则。 它将蛋白质的体内半衰期与其N末端残基的身份联系起来。 他得出的结论是,N-末端规则的相似但截然不同的版本适用于所有生物,从哺乳动物到真菌再到细菌。 因此,据此,应该有可能从蛋白质序列计算蛋白质的半衰期,并使用生物信息学方法估算蛋白质在细胞
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-12
文件大小:2048
提供者:
weixin_42166105
coronaobj-源码
电晕 coronaobj软件包是一个简单的单功能R软件包,用于生成SARS CoV-2(引起冠状病毒病的病毒,COVID-19)的科学准确的定制3D模型。 函数write_corona_obj()用顶点颜色写出Wavefront OBJ 3D模型,用户可以为病毒指定自己的颜色方案。 具体而言,用户可以指定病毒的脂质膜(主体)的颜色,封闭(不活动)的刺突蛋白和开放(活动)形式的颜色。 生成的OBJ文件可以在外部渲染器中导出和处理,也可以使用程序包在R中直接渲染。 整个软件包(包括型号)在回购中
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-10
文件大小:35651584
提供者:
weixin_42132056
multimodal-dataset:用于生成多模式CAFA基准测试集的代码和最少数据-源码
多峰数据集 代码,用于生成多模式基准测试集的最少数据。 1.选择样本进行培训,测试,验证 阈值序列同一性,以避免基于同源性的过度拟合。 为此,从获得.fasta格式的一组带注释的序列,并将其聚类(使用cdhit ),直到某个序列同一性阈值(例如40%)。 聚类后,由每个聚类中的质心组成的蛋白质集即为完整数据集。 这些蛋白质在.fasta的输出.fasta文件中cdhit 。 将该数据集适当地划分为训练集,验证集和保持集。 请记住,如果保持集是预先确定的,则必须删除其聚类中包含测试集成员的
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-10
文件大小:29360128
提供者:
weixin_42121272
Protein-Characterization--源码
确定蛋白质分离方法和等电点 我们的项目计划在给定pH和2个氨基酸序列的情况下简化蛋白质的表征。 该程序告诉用户如何使用两种方法在给定pH或中性(即生理性)pH下分离蛋白质及其电荷性质。 我们的主要功能protein_char接受3个输入:pH(范围为0-14)和2个氨基酸序列(以一个字母缩写形式表示为任意长度的字符串(即“ AAA”,“ AUGYKW”))。 为了过滤掉无效的输入,我们的功能能够识别pH是否在0-14(包括0和14)之间,以及氨基酸序列是否包含无效的氨基酸缩写。 如果输入的pH
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-10
文件大小:7168
提供者:
weixin_42118160
bazmac81-placro_MarResub-源码
普拉克罗 代码学院全栈开发文凭:里程碑项目2-交互式前端开发 巴里·麦克伦南(Barry MacLennan) 内容 项目目标 用户目标 用户故事 网站所有者目标 设计选择 字型 图示 颜色 站点地图和线框 功能与未来版本 使用WC3HTML和CSS检查 对等代码审查 用户故事 用户测试 已知的问题 使用的语言 使用的工具和库 部署方式 创建本地版本 UX开发 项目目标 该项目旨在为希望根据自己的宏计划进餐的人们构建网络应用程序,作为其健身计划的一部分。 基于此,有关计划宏的内容将称为Placr
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-09
文件大小:12582912
提供者:
weixin_42117116
ProLIF:蛋白质-配体相互作用指纹图谱-源码
ProLIF 文献资料 讲解 CI 聚酰亚胺 执照 描述 ProLIF(蛋白质-配体相互作用指纹图谱)是一种工具,用于生成用于从分子动力学轨迹和对接模拟中提取的蛋白质-配体和蛋白质-蛋白质相互作用的相互作用指纹。 它还支持DNA配体,DNA蛋白质和DNA-DNA相互作用。 您可以在上进行任何安装之前尝试一下。 文献资料 可在在线找到安装说明,文档和教程。 问题 如果发现错误,请在页面上打开一个问题。 讨论 如果您对如何使用ProLIF有疑问,或者想提供反馈或分享想法和新功能,请前往页
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-09
文件大小:4194304
提供者:
weixin_42146888
placro:一个交互式站点,可帮助人们根据自己的宏计划膳食。 里程碑项目2-CI-源码
普拉克罗 代码学院全栈开发文凭:里程碑项目2-交互式前端开发 巴里·麦克伦南(Barry MacLennan) 内容 项目目标 用户目标 用户故事 网站所有者目标 设计选择 字型 图示 颜色 站点地图和线框 功能与未来版本 使用WC3HTML和CSS检查 对等代码审查 用户故事 用户测试 已知的问题 使用的语言 使用的工具和库 部署方式 创建本地版本 UX开发 项目目标 该项目旨在为希望根据自己的宏计划进餐的人们构建网络应用程序,作为其健身计划的一部分。 基于此,有关计划宏的内容将称为Placr
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-09
文件大小:12582912
提供者:
weixin_42118160
NVDT:一种从基因序列预测蛋白质与蛋白质相互作用和非相互作用的新计算方法-源码
NVDT 一种新的计算方法,用于从基因序列预测蛋白质与蛋白质的相互作用和非相互作用。 第1部分:数据集 ---每个物种的正负样本。 每个.xlsx文件都有两列和几行。 每行代表一个蛋白质对(阳性样本是相互作用的蛋白质对,阴性样本是非相互作用的蛋白质对) (1) Real-Datasets :从DIP数据库中收集正样本,从Negatome数据库中收集负样本。 这里有两种,H。sapiens和M. musculus。 阳性样本数据集文件的名称应为物种名称,后跟“ Positive_Real”(例
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-08
文件大小:78643200
提供者:
weixin_42138788
twiner:Twiner是基于网络的正则化参数,基于两个数据集之间的相关性模式。 在目前的情况下,它被用来促进对与DNA微阵列和RNA测序表达值数据相关的特征的选择。 两个平台中的基因之间的相关性越高,与之相关的惩罚项越低-源码
缠绕 Twiner是基于网络的正则化参数,基于两个数据集之间的相关性模式。 在本研究中,它被用来促进与DNA微阵列和RNA测序表达值数据相关的特征的选择。 两个平台中的基因之间的相关性越高,与其相关的惩罚项越低。 Twiner代码文件包含: 用于GEO研究的微阵列数据采集 微阵列预处理步骤-分位数归一化 用于微阵列研究的数据集成-ComBat用于批次校正 用于TCGA研究的RNA测序数据采集 RNA测序跨平台与微阵列整合-分位数归一化 带有稀疏逻辑回归的分类模型:6.1。 弹性净罚分6.2。
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-08
文件大小:21504
提供者:
weixin_42113456
PPI-network-analysis:PPI网络的聚类和集中度分析-源码
Louvain聚类和蛋白质间相互作用(PPI)网络的集中度分析 该存储库包含python脚本 从PPI网络中检测具有统计意义的重要社区。 进行集中度分析 要求 python 3.0 网络x 2.4 qstest 1.1.0 熊猫1.0.4 用法 用于重大社区发现 python python/find__significant_module.py -n example/example_network.txt -g example/example_input.txt -o output_di
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-07
文件大小:58368
提供者:
weixin_42116847
蛋白质2-源码
投资组合游戏图像 投资组合游戏图像
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-14
文件大小:659456
提供者:
weixin_42134051
电晕:逆向工程SARS-CoV-2-源码
对冠状病毒(SARS-CoV-2)进行反向工程 从这里开始: :thought_balloon: 背景 该项目运用来理解病毒。 此处的目的仅仅是从基本原理理解病毒。 生物学与软件 从根本上说,生物系统是。 虽然不是一个完美的类比,但软件为思考生物学提供了有用的框架。 下表提供了该类比的粗略概述。 :microscope: 生物学 :laptop_computer: 软件 笔记 3字节宽的指令集,带有任意“” 多蛋白是具有多个片段的功能 精度达80% 这似乎很难预测: : 10.137
所属分类:
其它
发布日期:2021-01-31
文件大小:608256
提供者:
weixin_42112658
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