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搜索资源列表

  1. 用于对FASTA格式的蛋白序列进行理论酶切

  2. 利用生物质谱仪器进行蛋白鉴定和定量分析时，往往要获得一个蛋白的理论酶切肽段，该程序提供了一个对蛋白进行胰酶切的程序，规则（R、K切，RP、KP不切）。程序需要输入一个FASTA格式的蛋白序列文件（压缩包中是文件InternalStandards.fasta），输出文件可以自己设定，必须保证有输入和输出文件，程序才能运行。另外，程序还提供漏切次数和肽段长度选项

  3. 所属分类：专业指导

    • 发布日期：2009-12-30
    • 文件大小：3145728
    • 提供者：hailint

  1. 将cap3文件转换成fasta格式

  2. 在window DOS命令行下进入到文件所在目录 输入命令 java -jar cap32fasta.jar 如果运行出现内存不足的错误，则是由于要处理的文件太大引起的请 输入命令 java -jar -Xms128m -Xmx512m cap32fasta.jar

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2012-03-21
    • 文件大小：7168
    • 提供者：years9

  1. perl的fasta程序

  2. perl的fasta程序 FASTA是生物信息数据库的常用存储方式，了解FASTA格式的含义，用perl编写程序分离注释行内容，分离单行蛋白质序列，并转变成氨基酸三字母表示方式。说明使用的perl数据结构和程序的变量转换过程，解释含义。

  3. 所属分类：Perl

    • 发布日期：2013-01-02
    • 文件大小：1013
    • 提供者：ghostvvvv

  1. matlab实现的基因序列的预处理，筛选，重排列，规定格式输出

  2. 这段程序的主要作用是，从一个基因库中，查找到我们的目的基因，然后将该目的基因连带其后面的核苷酸序列一起按照fasta格式输出。为了方便后面的靶基因的预测，可以减少很大的工作量。

  3. 所属分类：专业指导

    • 发布日期：2014-04-08
    • 文件大小：962
    • 提供者：xhongd001

  1. 氨基酸符号序列转换为FASTA格式的蛋白质序列

  2. 氨基酸符号序列转换为FASTA格式的蛋白质序列，直接编译，将英文氨基酸序列粘贴到窗口，按回车即可输出转换结果。

  3. 所属分类：教育

    • 发布日期：2018-05-18
    • 文件大小：2048
    • 提供者：dbswhr

  1. fasta文件的切分算法——java实现

  2. 用于切分fasta文件，因为是按行读取，可以做到切分后每个子文件大小基本一致，并不会改变fasta文件的格式 也可以用于切分普通文件，主要注释掉判断 包不包含>那个if就可以了 如要切分fastq文件，可以先将fastq文件转化为fasta文件

  3. 所属分类：Java

    • 发布日期：2019-03-25
    • 文件大小：7168
    • 提供者：minekirito00

  1. Python导入fasta格式的数据，并把多行碱基变为一行

  2. 以前导入数据时都是一行行的导入，有时需要根据数据指定特定的分隔符，比如以>开头的fasta数据，在处理过程中顺便把多行的碱基序列变成了一行，自己摸索的写出来的

  3. 所属分类：专业指导

  1. seqtk, 在 fasta/q 格式中，用于处理序列的工具包.zip

  2. seqtk, 在 fasta/q 格式中，用于处理序列的工具包 简介Seqtk是一种快速而轻量的工具，用于处理FASTA或者FASTQ格式的序列。 它无缝地解析了FASTA和FASTQ文件，也可以通过gzip随意压缩。 要安装 seqtkgit clone https://github.com

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2019-09-18
    • 文件大小：24576
    • 提供者：weixin_38744270

  1. seqtk, 在 fasta/q 格式中，用于处理序列的工具包.zip

  2. seqtk, 在 fasta/q 格式中，用于处理序列的工具包 简介Seqtk是一种快速而轻量的工具，用于处理FASTA或者FASTQ格式的序列。 它无缝地解析了FASTA和FASTQ文件，也可以通过gzip随意压缩。 要安装 seqtkgit clone https://github.com

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2019-10-10
    • 文件大小：24576
    • 提供者：weixin_38744435

  1. FASTA格式序列特征提取方法

  2. FASTA格式序列特征提取方法，初砚硕，王清丽，在生物信息学中，FASTA格式是存储核酸序列或氨基酸序列的常用文本格式，每一个氨基酸或核酸用某个固定字母来表示。DIP数据库、NCBI数

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-01-03
    • 文件大小：373760
    • 提供者：weixin_38516491

  1. RDP数据库可培养的模式菌株——古菌的

  2. RDP上的可培养的模式菌株——古菌的dna序列文件 fasta格式

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2013-12-20
    • 文件大小：943104
    • 提供者：u013107122

  1. 统计基因组氨基酸频率.zip

  2. 说明： 1 程序会统计基因组中所有氨基酸的频率，如果有稀有氨基酸也会一并统计出。 2 要求输入序列格式为fasta格式。 3 此程序也适用于基因组AGCT含量统计。 使用说明： 1 将 统计氨基酸频率.exe 文件放入氨基酸序列文件所在文件夹 2 双击 统计氨基酸频率.exe 3 在弹出的对话框中输入 氨基酸序列文件文件名 4 完成

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-07-10
    • 文件大小：5242880
    • 提供者：liuninghua521

  1. 维基百科：FASTA格式

  2. 来自维基百科中文版本的FASTA文件格式介绍。由于维基百科被和谐了，特在此分享。

  3. 所属分类：医疗

    • 发布日期：2021-03-26
    • 文件大小：1048576
    • 提供者：devshilei

  1. generand:生成FASTAFASTQ，SAM或VCF格式的随机基因组数据-源码

  2. 慷慨的 生成FASTA / FASTQ，SAM或VCF格式的随机基因组数据，输出到标准输出。 输出数据是完全随机的，适合于新程序的基本测试和基准测试，或用于学术目的快速生成小样本。 Generand对于动态生成大型测试输入特别有用，因此无需手动生成和/或存储它们。 当前，随机化非常简单，但是将来我们可能会添加参数，以允许针对特定情况生成更实际的数据。 用法 Fasta通用序列，序列长度 fastq序列的序列长度 通用山姆染色体比对-每染色体序列长度 常规vcf染色体每染色体检出率 描述 G

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-15
    • 文件大小：8192
    • 提供者：weixin_42131798

  1. Chlamy-EnPhosSite-源码

  2. Chlamy-EnPhosSite Chlamy-EnPhosSite：一种基于深度学习的方法，用于莱茵衣藻特异性磷酸化位点的预测。 由Niraj Thapa在KC实验室中开发。 要求 后端= Tensorflow 凯拉斯脾气暴躁的生物蟒斯克莱恩Imblearn 文件提取 使用winrar或任何支持* .rar文件的应用程序进行提取。 从chlamy.part01开始。 将所有文件放在同一文件夹中。 数据集 数据集采用FASTA格式，其中蛋白质窗口大小为57。同时提供了训练和测试数据集。 有两

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-15
    • 文件大小：1024
    • 提供者：weixin_42164534

  1. gcgr：在控制台中使用DNA测序（FASTA格式）进行混沌游戏可视化，并使用多种绘图技术-源码

  2. 控制台可视化基因组序列 描述 混沌游戏的DNA测序可视化显示在控制台中，采用了更具选择性的绘图技术。 这是一个纯粹的投机项目，很有趣，应该这样看。 K变量 通过修改变量K，该程序将基因组序列划分为长度为K的子串，并使用子串中的每个碱基来更选择性地确定正方形的边界应向中途移动。 请参见上图，以获得直观的说明。 特别感谢 灵感和基础知识来自于Daniel Ashlock教授的《一书中有关分形DNA可视化的部分。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-26
    • 文件大小：8388608
    • 提供者：weixin_42174176

  1. 变量重新映射：用于在两个任意FASTA程序集之间重新映射VCF变量的管道-源码

  2. 变量重映射 用于以FASTA格式在两个任意程序集之间重新映射VCF变量的管道。 不需要链文件。 方法：从每个变体的侧翼序列创建读段，然后使用bowtie2将它们映射到新的程序集。 目前，它仅是SNP和短indel，但尚未通过更大或更复杂的变体进行测试。 先决条件 要运行此管道，您将需要安装和配置 。 管道使用需要在本地下载和安装的其他软件。 您可以手动获取它们，也可以使用 。 使用conda安装 git clone https://github.com/EBIvariation/varian

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-25
    • 文件大小：29696
    • 提供者：weixin_42117032

  1. gb2fasta：Perl脚本，用于将GenBank记录转换为FASTA格式-源码

  2. gb2fasta：Perl脚本，用于将GenBank记录转换为FASTA格式

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-05
    • 文件大小：14336
    • 提供者：weixin_42130786

  1. FASTX.jl：解析和处理生物序列的FASTA和FASTQ格式的文件-源码

  2. FASTX.jl：解析和处理生物序列的FASTA和FASTQ格式的文件

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-04
    • 文件大小：58368
    • 提供者：weixin_42115074

  1. FastaIO.jl：实用程序，可在Julia中读写FASTA格式的文件-源码

  2. FastaIO.jl：实用程序，可在Julia中读写FASTA格式的文件

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-03
    • 文件大小：30720
    • 提供者：weixin_42104947
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