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SNP检测方法PPT
SNP为继微卫星之后的第三代DNA标记,易于实现规模化检测
所属分类:
专业指导
发布日期:2010-06-07
文件大小:535552
提供者:
ew2002
网络分析仪软件,微波计算小软件,Sparam
网络分析仪软件,微波计算小软件,Sparam,可直接查看SNP文件
所属分类:
教育
发布日期:2011-11-03
文件大小:28672
提供者:
czlalvin
SNP文件处理
用于生物遗传里面,把一个SNP文件里面的 2个变成一个
所属分类:
C++
发布日期:2012-05-16
文件大小:981
提供者:
milllulei
SAP APO SNP中文培训录像
中文录像,物超所值,需要最新版WRF播放器,旧版本的可能播放不了声音。
所属分类:
专业指导
发布日期:2013-08-28
文件大小:17825792
提供者:
sap003
freebayes生信软件
此软件用于calling SNP, 已经打包成zip,解压了之后可以直接用。
所属分类:
其它
发布日期:2018-01-05
文件大小:59768832
提供者:
llh_1178
微测序技术检测12个Y-SNP及其群体遗传学研究
微测序技术检测12个Y-SNP及其群体遗传学研究,杜宏,张林,目的 应用SNaPshot Kit对Y染色体上12个SNP位点进行快速而准确的检测,对四川地区78个汉族男性无关个体进行群体遗传学研究, 并对性犯罪案�
所属分类:
其它
发布日期:2020-03-05
文件大小:724992
提供者:
weixin_38570854
MC1R基因与雀斑表型相关的SNP位点检测
MC1R基因与雀斑表型相关的SNP位点检测,曹利平,张旭,【目的】筛查成都地区汉族人群黑素皮质素受体1(melanocortin 1 receptor,MC1R)基因与雀斑相关联的SNPs。【方法】随机抽取20例无血缘关系个体
所属分类:
其它
发布日期:2020-02-29
文件大小:431104
提供者:
weixin_38710578
红麻野败型CMS胞质SNP分子标签的发掘
红麻野败型CMS胞质SNP分子标签的发掘,金刚,周瑞阳,在基于SRAP分子标记技术筛选的红麻野败型CMS胞质分子标签--Me14/Em8的基础上,通过在GenBank中的同源检索发现Me14/Em8引物组合的PCR扩增片段�
所属分类:
其它
发布日期:2020-02-23
文件大小:594944
提供者:
weixin_38606169
猪趋化因子CXCL12及受体基因CXCR4和CXCR7的克隆、SNP检测及性状关联分析
猪趋化因子CXCL12及受体基因CXCR4和CXCR7的克隆、SNP检测及性状关联分析,李小平,任云斌,母胎界面的血管发育是胚胎正常发育的关键,近年来,大量的研究表明母胎界面存在的趋化因子及其受体对胎盘母面与子面的血管发育起
所属分类:
其它
发布日期:2020-02-10
文件大小:348160
提供者:
weixin_38577261
CETP基因SNP/TaqIB与耐力训练对动态心功能影响的关联研究
CETP基因SNP/TaqIB与耐力训练对动态心功能影响的关联研究,李燕春,胡扬,研究目的:研究中国北方汉族人群CETP与耐力训练对动态心功能影响的关联关系。研究方法:采用PCR-RFLP方法测定解放军组CETP基因SNP/TaqIB�
所属分类:
其它
发布日期:2020-01-17
文件大小:406528
提供者:
weixin_38723810
Development of a single nucleotide polymorphism (SNP) DNA Microarray for Detection and Genotyping of SARS Coronavirus
用于SRAS冠状病毒SNP位点检测与分型芯片的研制,郭玺,刘斌,一种新的冠状病毒-SARS冠状病毒已经被证实是引起急性呼吸系统综合征的病原体。该病毒的刺突蛋白(S Protein)负责毒粒与宿主细胞的粘�
所属分类:
其它
发布日期:2020-01-03
文件大小:268288
提供者:
weixin_38540819
基于SNP数据染色体拷贝数检测结果可信度分析
基于SNP数据染色体拷贝数检测结果可信度分析,刘小成,刘元宁,利用SNP数据检测肿瘤细胞染色体拷贝数变异是癌症相关研究的一个热点,目前已有多种方法可以通过分析SNP array数据检测染色体拷贝数。
所属分类:
其它
发布日期:2020-01-02
文件大小:229376
提供者:
weixin_38687505
畜禽群体中基于SNP标记的亲子鉴定及亲本推断方法研究
畜禽群体中基于SNP标记的亲子鉴定及亲本推断方法研究,罗元宇,吴鹏,利用双亲高密度SNP标记信息,在畜禽群体中进行亲子鉴定及亲本推断新方法的计算机程序开发,并使用模拟的600 000个SNP标记对该程序进�
所属分类:
其它
发布日期:2020-01-02
文件大小:564224
提供者:
weixin_38711643
SSRG:SSRG管道的创建是一种简单而集中的工具,可用于研究基因组之间的遗传多样性-源码
创建是一种简单而集中的工具,可用于研究基因组之间的遗传多样性。 该管道具有两个独立的工作流程: 读映射/变体调用 遗传距离估计 对点突变感兴趣的人应该使用读映射/变体调用工作流程。 SSRG管道的独特功能在于使用从完整或草拟的基因组中合成短读段,然后将其输入到/变异调用工具中。 请注意,这种方法仅适用于单倍体基因组。 或者,用户可以选择任何FASTQ数据集与一起使用。 对遗传距离感兴趣的人应该使用遗传距离估计工作流程。 此工作流基于开发的出色工具 ,并专注于数据可视化。 遗传距离可以绘制为
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-14
文件大小:449536
提供者:
weixin_42099814
Extract-Flanking:R脚本,用于提取SNP位置上下游的侧翼序列-源码
Extract-Flanking:R脚本,用于提取SNP位置上下游的侧翼序列
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-13
文件大小:2048
提供者:
weixin_42125826
BAG_SNPs:使用基于SNP的野生物种种群的等位基因频率和遗传多样性估算种质库(BAG)样本量的脚本-源码
使用SNP和重采样数据集的种子/种质库中的等位基因频率和遗传多样性 使用等位基因频率和野生物种/种群的遗传多样性估算种质/种子库(BAG)中样本量的影响的脚本 番薯分三步走: 使用VCF计算野生物种/种群中的等位基因频率 使用野生物种/种群作为模型,使用VCF计算重采样数据集中的等位基因频率。 使用野生物种/种群作为使用GENIND的模型,计算重采样数据集中的遗传多样性。 Pilocarupus分五个步骤: 使用GENIND对象(空等位基因和等位基因> 50个副本)在自然种群和具有
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-08
文件大小:24576
提供者:
weixin_42116847
SNIPar:父母基因型的孟德尔插补,基于家庭的GWAS和多基因评分分析-源码
斯尼帕尔 SNIPar(父母的单核苷酸插补)是一个python库,用于从核心家庭中观察到的基因型中估算缺失的父母基因型,并进行基于家庭的全基因组关联和多基因评分分析。 主要特点: 给定一个核心家庭中观察到的基因型,估算缺失的父母基因型(impute_runner.py)。 使用观察到的和估算的父母基因型(fGWAS.py)执行基于家庭的GWAS。 使用观察/估算的父母基因型从SNP权重计算先证者,兄弟姐妹和父母的多基因得分,并进行基于家庭的多基因得分分析(fPGS.py脚本)。 文献资料
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-04
文件大小:11534336
提供者:
weixin_42120275
ParseSNP:正在进行ANP代码的SNP查看器-源码
解析SNP 正在进行Alpha代码的SNP查看器 该程序的主要目的是允许用户从Ancestory类型的原始文件23tome等中加载DNA SNP(单核苷酸多态性),并允许按RSID号进行搜索。 它还会将某些特定于阵列的代码转换为RSID。 目前,该代码尚在开发中,虽然可以正常工作,但它可能仍然存在错误且不完整。 祝你好运 罗宾
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-28
文件大小:52224
提供者:
weixin_42138525
CallVars:CallVars是一种自动的NGS工作流程,可将配对末端的样品FastQ直接带到感兴趣的少数临床相关变体(SNPs + Indels)-源码
CallVars: CallVars是一个自动化,可复制且可扩展的Snakemake工作流程,它采用成对末端的FastQ文件,其中包含来自目标基因组的下一代测序(NGS)数据/读取以及来自Illumina机器的整个外显子组,直接进入导致高可信度疾病的过滤列表/相关变体进行临床评估,以进行疾病诊断/治疗或预测疾病风险。 该工作流基于准则,即针对单个样品的种系短变异发现(SNP + Indel),并使用基因组分析工具包(GATK)v4.1.9.0。 CallVars配置为使用“ config.y
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-23
文件大小:2097152
提供者:
weixin_42120550
OSGenome:使用23AndMe和数据搜寻技术的遗传数据(SNP)开源Web应用程序-源码
OS基因组 使用23AndMe和数据搜寻技术的遗传数据(SNP)开源Web应用程序 描述 OS Genome是一个开放源代码Web应用程序,它使用户可以收集需要的信息以了解自己的基因组,而无需依赖具有未知隐私策略的外部服务。 OS Genome的目标是抓取各种资源并赋予个人基因组意义。 它创建用户特定基因组的响应网格。 这允许从过滤到excel导出的所有操作。 所有这些都使用Flask,Kendo和Python编程。 什么是SNP? 来自生物信息学的实用方法,医学博士Shui Qing Ye
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-05
文件大小:4194304
提供者:
weixin_42131705
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