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搜索资源列表

  1. trimmomatic 0.36

  2. 去除reads 两端低质量的base, Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data.

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2017-11-11
    • 文件大小：131072
    • 提供者：u013224461

  1. Trimmomatic Manual

  2. Trimmomati 用于去除 Illumina平台的FASTQ序列中的Adapter，根据碱基质量值修整FASTQ序列文件

  3. 所属分类：讲义

    • 发布日期：2019-03-26
    • 文件大小：330752
    • 提供者：u011262253

  1. FM_Intern_Wrap-源码

  2. FM_Intern_Wrap 语言和包装 所需软件 Trimmomatic- 软件安装 管道脚本布局 hyb_wrap.py 这是包装脚本，旨在接受用户输入并指导管道使用氨基酸靶标或核苷酸靶标。 脚本输入： --target_enrichment_data如果目标富集测序方法 --whole_genome_data如果数据是整个基因组输入数据 --assembly_data如果数据是SPAdes程序集还是非SPAdes程序集 getNameList.py getNameList.py将样

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-26
    • 文件大小：394240
    • 提供者：weixin_42119358

  1. 剧本-源码

  2. Jordbear的脚本 概述 该存储库包含为各种目的而开发的许多脚本。 用于分析DNA测序数据 编写了许多Bash脚本，以使用免费和开源的生物信息学工具自动执行DNA测序数据的处理。 所使用的工具包括但不限于：Trimmomatic，Bowtie2，HISAT2，Samtools，Picard和Bedtools。 在适当的情况下，需要安装这些工具才能成功运行脚本。 强烈建议将包含使用脚本的目录添加到PATH变量，以便Bash终端可以轻松调用它们。 编写了许多Python脚本来整理和绘制来自处

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-22
    • 文件大小：171008
    • 提供者：weixin_42116604

  1. TreehopperSeq：实用程序脚本，数据分析管道以及带有非模型生物的RNA-Seq的文档的集合-源码

  2. TreehopperSeq 实用程序脚本，数据分析管道和非模型生物RNA-Seq的文档的集合。 此仓库中使用的软件： 三位一体（trinityRNAseq）/领结/ RSEM TRIMMOMATIC 领结2 EnTAP R（生物导体包装） RNA-Seq读取处理管线 TODO为RNA QC管道和自述文件添加脚本。 高质量修剪显示为“完成” 条PolyA尾巴完成 集合 制作小的测试数据集 注释和装配优化 TODO添加用于使用EnTAP注释读段的脚本，使用USEARCH来聚簇蛋白质

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-17
    • 文件大小：10485760
    • 提供者：weixin_42116713

  1. RNASeq分析工具包-源码

  2. RNASeq-analysis-toolkit测试版 该存储库包含（希望）一个易于使用的工具来分析RNASeq数据。 依存关系 bowtie2 HTSeq R包 DESeq2 皮尔 dplyr 分割形状 ggplot2 RColorBrewer 增强火山 该工具假定所有预处理步骤均已执行。 这包括： 质量控制 可以使用诸如fastqc 工具评估序列质量 此后，可以使用例如trimmomatic 或cutadapt 评估搁浅 我以前使用过的脚本可以在这里找到： ://rs

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-13
    • 文件大小：885760
    • 提供者：weixin_42130889