注册会员 | 设为首页 | 加入收藏夹
您好，欢迎光临本网站！[请登录] ！[注册会员]！  

搜索资源列表

  1. CoffeeProt-源码

  2. CoffeeProt：用于蛋白质组范围内系统遗传学相关性和功能富集的在线工具 基因组学，蛋白质组学和表型性状在遗传多样性人群中的整合是发现新型生物调节剂的有力方法。复杂数据量的不断增长要求各种科学家可以使用易于使用的新工具来发现和可视化功能相关的关联。为了满足此要求，我们开发了CoffeeProt，这是一种开放源代码工具，可以分析与蛋白质网络和表型性状相关的遗传变异。 CoffeeProt使用蛋白质组学数据进行相关网络分析，并注释蛋白质-蛋白质相互作用，亚细胞定位和药物关联。然后，它整合了遗传和

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-19
    • 文件大小：67108864
    • 提供者：weixin_42098251

  1. OmicNavigator-源码

  2. OmicNavigator：用于Omic数据分析和可视化的开源软件 通过交互式Web应用程序探索眼科分析的结果可促进跨学科的协作和生物学发现。 OmicNavigator是用于对高通量生物学实验结果进行存档和交互式探索的开源软件。该软件使omic数据分析人员（通常是生物信息学家）仅使用统计编程语言R就可以根据其工作结果创建可自定义的Web应用程序。OmicNavigator捆绑为一个R包，其中包含Web应用程序代码，用于程序访问和数据的R函数沉积物，以及用于存储测量值（例如RNAseq读取计数）

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-19
    • 文件大小：160768
    • 提供者：weixin_42136477

  1. MSPC：使用来自重复样本的综合证据评估ChIP-seq峰-源码

  2. | | 关于 ChIP-seq样品的分析输出许多富集区域，每个富集区域指示蛋白质与DNA的相互作用或特定的染色质修饰。 当读取的分布与背景显着不同且其对应的显着性度量（p值）低于用户定义的阈值时，将调用富集区域（通常称为“峰值”）。 当分析重复样品时，预期会有重叠的富集区域。 因此，可以将这种重复的证据用于局部降低接受峰所需的最低显着性。 在这里，我们提出了一种联合分析弱峰的方法。 给定一组来自​​（生物或技术）重复的峰，该方法结合了重叠富集区域的p值：用户可以选择一个重叠峰合并显着性的阈值

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-27
    • 文件大小：2097152
    • 提供者：weixin_42138716

  1. DROMPAplus：ChIP-seq管道工具，用于对多个ChIP-seq样本进行质量检查，标准化，统计分析和可视化-源码

  2. DROMPAplus 1.概述 DROMPA（DRaw和观察多种浓缩曲线和注释）是一种ChIP-seq管道工具，可满足各种需求，包括质量检查，分析和多个ChIP样品的可视化。 DROMPAplus用C ++编写，具有许多有价值的功能。 DROMPAplus： 接受多种地图文件格式（SAM，BAM，CRAM，Bowtie，TagAlign（.gz））并读取分发格式（WIG（.gz），bigWig，bedGraph）。 支持加标归一化和总读取归一化。 输出用于ChIP-seq分析的各种质量指

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-26
    • 文件大小：25165824
    • 提供者：weixin_42097914

  1. 生物富集-源码

  2. Bioplentia是Minecraft的附加组件，可添加20多个新的生物群落。 除了新的生物群落外， Bioplentia还添加了新的生物，构件，树木，结构。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-26
    • 文件大小：61865984
    • 提供者：weixin_42133918

  1. OmicNavigatorWebApp-源码

  2. OmicNavigator：用于Omic数据分析和可视化的开源软件 通过交互式Web应用程序探索眼科分析的结果可促进跨学科的协作和生物学发现。 OmicNavigator是用于对高通量生物学实验结果进行存档和交互式探索的开源软件。 该软件使omic数据分析人员（通常是生物信息学家）仅使用统计编程语言R就可以根据其工作结果创建可自定义的Web应用程序。OmicNavigator捆绑为一个R包，其中包含Web应用程序代码，用于程序访问和数据的R函数沉积物，以及用于存储测量值（例如RNAseq读取计数

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-18
    • 文件大小：669696
    • 提供者：weixin_42168902

  1. safepy：功能丰富的空间分析（SAFE）的Python实现-源码

  2. 介绍 SAFE（或功能丰富的空间分析）是一种自动化的网络注释算法。 给定一个生物网络和一组感兴趣的功能组或定量特征，SAFE会进行局部富集分析，以确定每个组或特征对网络中哪些区域的代表过多。 SAFE可视化网络并将检测到的富集映射到网络上。 SAFE最初是在MATLAB中实现的，并存储在 。 但是，从2017年初开始，仅出于传统目的维护MATLAB实现。 与SAFE相关的新工作正在移至Python和此存储库。 警告。 该软件包仍在开发中。 请谨慎使用。 入门 SAFE需要Python 3和e

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-15
    • 文件大小：7340032
    • 提供者：weixin_42101641

  1. 作品集-源码

  2. 果蝇控制软件的4种物种注释记述软件 现实世界中的现实世界的分析GO con el software 软件管理软件 英文翻译 我使用在功能上注释了4种果蝇的转录 我使用执行了GO术语富集分析 我用搜索直系同源蛋白 最终准生物科学和自然法典 通用数据传输系统 伯努利研究与发展研究中心 RMarkdown的信息通报 Diseñamosun海报 英文翻译 精确和自然科学学院授课的主题为Biometry II的最终项目。 我们使用了由INDEC生成的数据库，数据是通过调查收集的。 为了生成贝努利

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-09
    • 文件大小：1024
    • 提供者：weixin_42119866

  1. graphia：用于创建和分析图的可视化工具-源码

  2. Graphia是功能强大的开源视觉分析应用程序，旨在帮助解释大型和复杂的数据集。 产品特点 支持从原始CSV到GraphML的多种输入数据格式 使用诸如Pearson相关系数的算法创建相关图 可视化数百万个数据点和关系 交互式可视化和2D或3D布局 基于属性信息的灵活搜索功能 使用Louvain或MCL算法进行快速，可调整的网络群集 图形度量算法，包括PageRank，Beetess和偏心率 富集分析 根据基于数字或字符串的属性表达式过滤图形元素 可定制且易于使用的网络搜索 轻松导出和共享分析结

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-05
    • 文件大小：31457280
    • 提供者：weixin_42138525

  1. viralrecon：汇编和宿主内低频变体，需要病毒样品-源码

  2. 介绍 nfcore / viralrecon是一种生物信息学分析管道，用于执行组装和宿主内/低频变异检测病毒样品。 该管道支持散弹枪（例如，直接从临床样品直接测序）和基于富集的文库制备方法（例如，基于扩增子的；或基于探针捕获）的短读Illumina测序数据。 该管道是使用构建的， 是一种工作流工具，可以以非常便携的方式跨多个计算基础架构运行任务。 它带有Docker容器，使安装变得简单，结果可高度重现。 此外，使用AWS云在完整数据集上运行管道的自动化连续集成测试可确保代​​码稳定。 管道摘要

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-02
    • 文件大小：1048576
    • 提供者：weixin_42131367

  1. ChIP-AP:染色质免疫沉淀测序分析管线-源码

  2. 芯片 CH romatin我mmuno P recipitation测序nalysis P ipeline 本质上简单的ChIP-Seq分析 由Jeremiah Suryatenggara和Mahmoud A.Bassal开发 介绍 ChIP-Seq是一种用于分析蛋白质-DNA相互作用并鉴定所述蛋白质的结合位点的技术。 生物信息学分析中的关键步骤是调用“峰”或富集区域，对应于蛋白质与DNA的结合位点。 据广泛报道，在所有生物信息学分析步骤中，最有可能影响研究结果的步骤是峰调用（Chen等，

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-31
    • 文件大小：96468992
    • 提供者：weixin_42175971