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搜索资源列表

  1. 用于对FASTA格式的蛋白序列进行理论酶切

  2. 利用生物质谱仪器进行蛋白鉴定和定量分析时，往往要获得一个蛋白的理论酶切肽段，该程序提供了一个对蛋白进行胰酶切的程序，规则（R、K切，RP、KP不切）。程序需要输入一个FASTA格式的蛋白序列文件（压缩包中是文件InternalStandards.fasta），输出文件可以自己设定，必须保证有输入和输出文件，程序才能运行。另外，程序还提供漏切次数和肽段长度选项

  3. 所属分类：专业指导

    • 发布日期：2009-12-30
    • 文件大小：3145728
    • 提供者：hailint

  1. 将cap3文件转换成fasta格式

  2. 在window DOS命令行下进入到文件所在目录 输入命令 java -jar cap32fasta.jar 如果运行出现内存不足的错误，则是由于要处理的文件太大引起的请 输入命令 java -jar -Xms128m -Xmx512m cap32fasta.jar

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2012-03-21
    • 文件大小：7168
    • 提供者：years9

  1. fasta算法，Smith-waterman算法，编辑距离算法，最长公共子串算法

  2. fasta算法，Smith-waterman算法，编辑距离算法，最长公共子串算法

  3. 所属分类：C/C++

    • 发布日期：2017-02-21
    • 文件大小：214016
    • 提供者：bigfish_yukang

  1. 氨基酸符号序列转换为FASTA格式的蛋白质序列

  2. 氨基酸符号序列转换为FASTA格式的蛋白质序列，直接编译，将英文氨基酸序列粘贴到窗口，按回车即可输出转换结果。

  3. 所属分类：教育

    • 发布日期：2018-05-18
    • 文件大小：2048
    • 提供者：dbswhr

  1. 分割fasta文件的python脚本

  2. 文件脚本可将大的fasta文件中的序列，按照个数均分，分割成多个fasta文件，便于对各个小文件中的序列进行后续操作

  3. 所属分类：互联网

    • 发布日期：2018-08-21
    • 文件大小：2048
    • 提供者：xilance

  1. FASTA格式序列特征提取方法

  2. FASTA格式序列特征提取方法，初砚硕，王清丽，在生物信息学中，FASTA格式是存储核酸序列或氨基酸序列的常用文本格式，每一个氨基酸或核酸用某个固定字母来表示。DIP数据库、NCBI数

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-01-03
    • 文件大小：373760
    • 提供者：weixin_38516491

  1. 维基百科：FASTA格式

  2. 来自维基百科中文版本的FASTA文件格式介绍。由于维基百科被和谐了，特在此分享。

  3. 所属分类：医疗

    • 发布日期：2021-03-26
    • 文件大小：1048576
    • 提供者：devshilei

  1. toolBoxForMutantAndWTGenomes:Rscript操作Fasta或GTF-源码

  2. toolBoxForMutantAndWTGenomes Rscr ipt来操纵fasta或gtf。 每个R脚本都可以从RStudio获取，也可以在命令行模式下启动： Rscr ipt ... 如果您更喜欢命令行，可以通过Rscr ipt ... --help获得用法。 完整的文档 问题 如果您有任何问题/疑问/评论，请随时在github中打开一个问题或给我发送电子邮件至

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-21
    • 文件大小：23552
    • 提供者：weixin_42097369

  1. susCovONT:通过ONT测序生成共识文件.fasta文件并识别穿山甲谱系和Sars-CoV-2基因组的下一个菌株的管道-源码

  2. 可持续发展 通过ONT测序生成共识文件.fasta文件并识别穿山甲谱系和Sars-CoV-2基因组的下一个菌株的管道。 该管道将​​名称为的文件夹作为输入，其中包含来自Sars-CoV-2 ONT测序的文件夹fast5_pass和fast5_pass以及fastq_pass sequencing_summary*.txt以及链接条形码和样品名称的CSV文件，并以及_report.csv ，其中包括， 和 。 安装 使用susCovONT/scr ipts/install.sh安装所有必要的工具和

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-19
    • 文件大小：28672
    • 提供者：weixin_42171132

  1. STRpipe:用于STR检测和创建带掩码的FASTA文件的自定义管道-源码

  2. STRpipe 用于STR检测和创建带掩码的FASTA文件的自定义管道

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-13
    • 文件大小：5120
    • 提供者：weixin_42132325

  1. kiley:FASTA->共识-源码

  2. Kiley-共识模块 作者：万正增谷 电子邮件： 安装 安装 。 git clone --recursive https://github.com/ban-m/kiley.git cd kiley && cargo build --release将在./target/release下创建kiley二进制./target/release cargo test --release -- --nocapture如果需要， cargo test --release -- --nocapture

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-13
    • 文件大小：45056
    • 提供者：weixin_42139302

  1. ReAmBaP:从FASTA文件中删除模棱两可的碱基对-源码

  2. ReAmBaP-删除歧义碱基对 从FASTA文件中删除模棱两可的碱基对。 非常适合像Snippy这样的工具，这些工具不喜欢模棱两可的碱基对。 用法 python reambap.py [input] [output]

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-12
    • 文件大小：1024
    • 提供者：weixin_42116058

  1. 变量重新映射：用于在两个任意FASTA程序集之间重新映射VCF变量的管道-源码

  2. 变量重映射 用于以FASTA格式在两个任意程序集之间重新映射VCF变量的管道。 不需要链文件。 方法：从每个变体的侧翼序列创建读段，然后使用bowtie2将它们映射到新的程序集。 目前，它仅是SNP和短indel，但尚未通过更大或更复杂的变体进行测试。 先决条件 要运行此管道，您将需要安装和配置 。 管道使用需要在本地下载和安装的其他软件。 您可以手动获取它们，也可以使用 。 使用conda安装 git clone https://github.com/EBIvariation/varian

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-25
    • 文件大小：29696
    • 提供者：weixin_42117032

  1. FNA：处理FNA文件的某些功能（Fasta和Newick）-源码

  2. FNA：处理FNA文件的某些功能（Fasta和Newick）

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-20
    • 文件大小：6144
    • 提供者：weixin_42133969

  1. FindTelomeres：用于在FASTA文件中查找端粒重复序列（TTAGGGCCCTAA）的python脚本-源码

  2. 这个脚本做什么？ 这是用于在FASTA文件中查找端粒重复序列（TTAGGG / CCCTAA）的工具。 该脚本不做什么？ 它只会在序列的开头和结尾寻找端粒。 它仅查找TTAGGG / CCCTAA重复序列的变体。 它是如何做到的？ 它以FASTA文件作为输入，并逐一遍历其中的序列。 在每个序列的开头和结尾，它都会忽略N（未知碱基）。 对于每个序列，它将查看前（最后）50个核苷酸，并评估端粒重复覆盖了该序列的多少。 这是故意灵活的，以允许测序错误和端粒基序的序列/长度变化。 更具体地说，如

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-18
    • 文件大小：34816
    • 提供者：weixin_42128963

  1. genozip：用于基因组文件（FASTQ，SAMBAM，VCF，FASTA，GVF，23andMe ...）的压缩器，比gzip压缩多达5倍，并且速度也更快-源码

  2. Genozip （可在Conda ， Docker Hub和） Genozip是一种用于基因组文件的压缩器-虽然它可以压缩任何文件（即不仅是基因组文件），但它经过优化可以压缩FASTQ，SAM / BAM / CRAM，VCF / BCF，FASTA，GVF，Phylip和23andMe文件。 如果它们已经使用.gz .bz2 .xz进行压缩，它甚至可以对其进行压缩（有关受支持的文件类型的完整列表，请参见'genozip --help = input'）。 压缩率取决于要压缩的数据，通常，压缩

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-15
    • 文件大小：3145728
    • 提供者：weixin_42150341

  1. csproj：使用C＃制作的自定义DNA序列搜索套件，用于.FASTA文件-源码

  2. csproj：使用C＃制作的自定义DNA序列搜索套件，用于.FASTA文件

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-12
    • 文件大小：17408
    • 提供者：weixin_42166261

  1. gb2fasta：Perl脚本，用于将GenBank记录转换为FASTA格式-源码

  2. gb2fasta：Perl脚本，用于将GenBank记录转换为FASTA格式

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-05
    • 文件大小：14336
    • 提供者：weixin_42130786

  1. FASTX.jl：解析和处理生物序列的FASTA和FASTQ格式的文件-源码

  2. FASTX.jl：解析和处理生物序列的FASTA和FASTQ格式的文件

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-04
    • 文件大小：58368
    • 提供者：weixin_42115074

  1. FastaIO.jl：实用程序，可在Julia中读写FASTA格式的文件-源码

  2. FastaIO.jl：实用程序，可在Julia中读写FASTA格式的文件

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-03
    • 文件大小：30720
    • 提供者：weixin_42104947
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