生物基因组 重测序的 工具包 ./iTool -h 看help 共有10 部分组成,别如下: Fatools Tools For Fasta Fqtools Tools For Fastq SOAPtools Tools For SOAP CNStools Tools For CNS Xamtools Tools For Sam,Bam Gfftools Tools For Gff Formtools Tools For Form convert Filetools Tools For Fil
Fqutils提供了一套基本的生物信息学序列数据FASTQ格式与命令行工具。格雷格·汉农的优良Fastx工具包套件的补充。的是,它正确地处理FASTQ格式发布的标准,该标准明确允许多行序列和质量得分记录信息每所描述的特征之一,Fqutils。 fqutils旨在作为早期部分postsequencing管道和质量评估进程的一部分,是有用的。 Fqutils provides a basic set of bioinformatics commandline tools for working w
bgi2illumina
将FASTQ记录的BGI排序的标头转换为与Illumina兼容的标头。
安装
只需运行make:
make // this will build a binary
make install // this will copy binary into /usr/local/bin
删除现有的“安装”运行
make uninstall
安装
编译过程非常简单,如果出于某些原因您对此比较满意,则可以不使用make进行处理。
用gcc编译源代码:
gcc