GATK-SV
用于Illumina短读全基因组测序(WGS)数据的结构变异发现管道。
目录
原始呼叫者和证据收集
批量质量控制
-gCNV模型创建
批量证据合并,BAF生成和深度调用者
网站集群
网站指标
过滤
跨批次站点合并
基因分型
基因型优化(可选)
跨批次集成,复杂事件解决和VCF清理
下游过滤
注释
质量控制和可视化
附加模块-Mosaic和de novo
部署和执行:
一个帐户。
支持(WDL)的流执行系统,可以:
(v36或更高版本)。强烈建议使用专用服务器。
或 (请注意,此平